Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5Z9

4930504O13Rik, RIKEN cDNA 4930504O13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930504O13RikQ8C5Z9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
4930504O13RikQ8C5Z9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
4930504O13RikQ8C5Z9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
4930504O13RikQ8C5Z9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
4930504O13RikQ8C5Z9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
4930504O13RikQ8C5Z9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
4930504O13RikQ8C5Z9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
4930504O13RikQ8C5Z9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
4930504O13RikQ8C5Z9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
4930504O13RikQ8C5Z9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
4930504O13RikQ8C5Z9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
4930504O13RikQ8C5Z9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
4930504O13RikQ8C5Z9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
4930504O13RikQ8C5Z9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
4930504O13RikQ8C5Z9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
4930504O13RikQ8C5Z9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
4930504O13RikQ8C5Z9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
4930504O13RikQ8C5Z9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
4930504O13RikQ8C5Z9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
4930504O13RikQ8C5Z9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
4930504O13RikQ8C5Z9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
4930504O13RikQ8C5Z9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
4930504O13RikQ8C5Z9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
4930504O13RikQ8C5Z9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
4930504O13RikQ8C5Z9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
4930504O13RikQ8C5Z9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
4930504O13RikQ8C5Z9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
4930504O13RikQ8C5Z9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
4930504O13RikQ8C5Z9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
4930504O13RikQ8C5Z9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
4930504O13RikQ8C5Z9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
4930504O13RikQ8C5Z9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
4930504O13RikQ8C5Z9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
4930504O13RikQ8C5Z9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
4930504O13RikQ8C5Z9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
4930504O13RikQ8C5Z9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
4930504O13RikQ8C5Z9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
4930504O13RikQ8C5Z9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
4930504O13RikQ8C5Z9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
4930504O13RikQ8C5Z9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
4930504O13RikQ8C5Z9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
4930504O13RikQ8C5Z9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
4930504O13RikQ8C5Z9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
4930504O13RikQ8C5Z9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
4930504O13RikQ8C5Z9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
4930504O13RikQ8C5Z9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
4930504O13RikQ8C5Z9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
4930504O13RikQ8C5Z9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
4930504O13RikQ8C5Z9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
4930504O13RikQ8C5Z9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
4930504O13RikQ8C5Z9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
4930504O13RikQ8C5Z9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
4930504O13RikQ8C5Z9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
4930504O13RikQ8C5Z9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
4930504O13RikQ8C5Z9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
4930504O13RikQ8C5Z9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
4930504O13RikQ8C5Z9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
4930504O13RikQ8C5Z9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
4930504O13RikQ8C5Z9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
4930504O13RikQ8C5Z9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
4930504O13RikQ8C5Z9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
4930504O13RikQ8C5Z9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
4930504O13RikQ8C5Z9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
4930504O13RikQ8C5Z9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
4930504O13RikQ8C5Z9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
4930504O13RikQ8C5Z9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
4930504O13RikQ8C5Z9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
4930504O13RikQ8C5Z9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
4930504O13RikQ8C5Z9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
4930504O13RikQ8C5Z9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
4930504O13RikQ8C5Z9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
4930504O13RikQ8C5Z9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
4930504O13RikQ8C5Z9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
4930504O13RikQ8C5Z9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
4930504O13RikQ8C5Z9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
4930504O13RikQ8C5Z9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
4930504O13RikQ8C5Z9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
4930504O13RikQ8C5Z9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
4930504O13RikQ8C5Z9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
4930504O13RikQ8C5Z9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
4930504O13RikQ8C5Z9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
4930504O13RikQ8C5Z9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
4930504O13RikQ8C5Z9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
4930504O13RikQ8C5Z9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
4930504O13RikQ8C5Z9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
4930504O13RikQ8C5Z9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
4930504O13RikQ8C5Z9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
4930504O13RikQ8C5Z9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
4930504O13RikQ8C5Z9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.2 ms