Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cldn17Q8BXA6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cldn17Q8BXA6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cldn17Q8BXA6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cldn17Q8BXA6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cldn17Q8BXA6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cldn17Q8BXA6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cldn17Q8BXA6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cldn17Q8BXA6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Cldn17Q8BXA6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cldn17Q8BXA6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cldn17Q8BXA6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cldn17Q8BXA6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn17Q8BXA6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn17Q8BXA6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn17Q8BXA6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cldn17Q8BXA6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cldn17Q8BXA6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cldn17Q8BXA6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cldn17Q8BXA6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cldn17Q8BXA6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cldn17Q8BXA6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cldn17Q8BXA6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cldn17Q8BXA6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cldn17Q8BXA6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cldn17Q8BXA6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cldn17Q8BXA6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn17Q8BXA6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn17Q8BXA6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn17Q8BXA6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn17Q8BXA6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn17Q8BXA6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn17Q8BXA6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn17Q8BXA6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cldn17Q8BXA6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cldn17Q8BXA6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cldn17Q8BXA6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cldn17Q8BXA6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cldn17Q8BXA6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cldn17Q8BXA6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cldn17Q8BXA6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cldn17Q8BXA6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cldn17Q8BXA6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn17Q8BXA6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn17Q8BXA6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn17Q8BXA6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn17Q8BXA6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn17Q8BXA6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn17Q8BXA6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn17Q8BXA6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn17Q8BXA6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn17Q8BXA6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn17Q8BXA6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cldn17Q8BXA6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cldn17Q8BXA6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cldn17Q8BXA6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cldn17Q8BXA6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cldn17Q8BXA6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cldn17Q8BXA6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cldn17Q8BXA6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cldn17Q8BXA6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cldn17Q8BXA6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cldn17Q8BXA6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cldn17Q8BXA6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cldn17Q8BXA6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cldn17Q8BXA6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cldn17Q8BXA6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cldn17Q8BXA6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn17Q8BXA6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn17Q8BXA6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn17Q8BXA6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn17Q8BXA6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn17Q8BXA6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn17Q8BXA6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn17Q8BXA6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn17Q8BXA6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn17Q8BXA6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn17Q8BXA6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn17Q8BXA6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn17Q8BXA6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn17Q8BXA6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn17Q8BXA6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn17Q8BXA6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn17Q8BXA6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn17Q8BXA6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn17Q8BXA6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn17Q8BXA6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn17Q8BXA6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn17Q8BXA6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn17Q8BXA6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn17Q8BXA6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn17Q8BXA6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn17Q8BXA6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn17Q8BXA6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn17Q8BXA6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn17Q8BXA6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn17Q8BXA6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn17Q8BXA6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn17Q8BXA6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cldn17Q8BXA6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
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