Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lmod1Q8BVA4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lmod1Q8BVA4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Lmod1Q8BVA4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lmod1Q8BVA4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lmod1Q8BVA4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lmod1Q8BVA4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lmod1Q8BVA4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lmod1Q8BVA4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Lmod1Q8BVA4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lmod1Q8BVA4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lmod1Q8BVA4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lmod1Q8BVA4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lmod1Q8BVA4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lmod1Q8BVA4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lmod1Q8BVA4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lmod1Q8BVA4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lmod1Q8BVA4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lmod1Q8BVA4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lmod1Q8BVA4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lmod1Q8BVA4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lmod1Q8BVA4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lmod1Q8BVA4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lmod1Q8BVA4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lmod1Q8BVA4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Lmod1Q8BVA4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lmod1Q8BVA4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Lmod1Q8BVA4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Lmod1Q8BVA4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lmod1Q8BVA4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Lmod1Q8BVA4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lmod1Q8BVA4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Lmod1Q8BVA4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lmod1Q8BVA4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lmod1Q8BVA4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lmod1Q8BVA4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lmod1Q8BVA4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lmod1Q8BVA4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lmod1Q8BVA4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lmod1Q8BVA4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lmod1Q8BVA4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Lmod1Q8BVA4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Lmod1Q8BVA4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Lmod1Q8BVA4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Lmod1Q8BVA4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Lmod1Q8BVA4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Lmod1Q8BVA4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Lmod1Q8BVA4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Lmod1Q8BVA4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Lmod1Q8BVA4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lmod1Q8BVA4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lmod1Q8BVA4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lmod1Q8BVA4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lmod1Q8BVA4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lmod1Q8BVA4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Lmod1Q8BVA4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Lmod1Q8BVA4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Lmod1Q8BVA4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Lmod1Q8BVA4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Lmod1Q8BVA4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Lmod1Q8BVA4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Lmod1Q8BVA4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Lmod1Q8BVA4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Lmod1Q8BVA4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lmod1Q8BVA4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lmod1Q8BVA4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lmod1Q8BVA4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lmod1Q8BVA4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lmod1Q8BVA4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lmod1Q8BVA4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lmod1Q8BVA4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lmod1Q8BVA4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lmod1Q8BVA4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lmod1Q8BVA4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lmod1Q8BVA4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lmod1Q8BVA4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lmod1Q8BVA4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lmod1Q8BVA4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lmod1Q8BVA4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lmod1Q8BVA4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lmod1Q8BVA4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lmod1Q8BVA4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lmod1Q8BVA4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lmod1Q8BVA4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lmod1Q8BVA4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lmod1Q8BVA4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lmod1Q8BVA4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lmod1Q8BVA4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lmod1Q8BVA4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lmod1Q8BVA4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lmod1Q8BVA4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lmod1Q8BVA4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lmod1Q8BVA4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lmod1Q8BVA4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lmod1Q8BVA4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lmod1Q8BVA4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lmod1Q8BVA4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lmod1Q8BVA4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Lmod1Q8BVA4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lmod1Q8BVA4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms