Protein–RNA interactions for Protein: Q8BU47

E330017A01Rik, Ferritin, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330017A01RikQ8BU47 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
E330017A01RikQ8BU47 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
E330017A01RikQ8BU47 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
E330017A01RikQ8BU47 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
E330017A01RikQ8BU47 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
E330017A01RikQ8BU47 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
E330017A01RikQ8BU47 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E330017A01RikQ8BU47 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E330017A01RikQ8BU47 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E330017A01RikQ8BU47 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
E330017A01RikQ8BU47 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E330017A01RikQ8BU47 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
E330017A01RikQ8BU47 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E330017A01RikQ8BU47 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E330017A01RikQ8BU47 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
E330017A01RikQ8BU47 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
E330017A01RikQ8BU47 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
E330017A01RikQ8BU47 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
E330017A01RikQ8BU47 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
E330017A01RikQ8BU47 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
E330017A01RikQ8BU47 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
E330017A01RikQ8BU47 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
E330017A01RikQ8BU47 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
E330017A01RikQ8BU47 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
E330017A01RikQ8BU47 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
E330017A01RikQ8BU47 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
E330017A01RikQ8BU47 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
E330017A01RikQ8BU47 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E330017A01RikQ8BU47 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E330017A01RikQ8BU47 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E330017A01RikQ8BU47 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E330017A01RikQ8BU47 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
E330017A01RikQ8BU47 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
E330017A01RikQ8BU47 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
E330017A01RikQ8BU47 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
E330017A01RikQ8BU47 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
E330017A01RikQ8BU47 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E330017A01RikQ8BU47 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E330017A01RikQ8BU47 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E330017A01RikQ8BU47 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E330017A01RikQ8BU47 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E330017A01RikQ8BU47 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
E330017A01RikQ8BU47 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E330017A01RikQ8BU47 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E330017A01RikQ8BU47 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E330017A01RikQ8BU47 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E330017A01RikQ8BU47 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E330017A01RikQ8BU47 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E330017A01RikQ8BU47 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E330017A01RikQ8BU47 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E330017A01RikQ8BU47 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
E330017A01RikQ8BU47 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E330017A01RikQ8BU47 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E330017A01RikQ8BU47 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E330017A01RikQ8BU47 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E330017A01RikQ8BU47 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E330017A01RikQ8BU47 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E330017A01RikQ8BU47 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
E330017A01RikQ8BU47 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
E330017A01RikQ8BU47 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E330017A01RikQ8BU47 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
E330017A01RikQ8BU47 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
E330017A01RikQ8BU47 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
E330017A01RikQ8BU47 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
E330017A01RikQ8BU47 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
E330017A01RikQ8BU47 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
E330017A01RikQ8BU47 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
E330017A01RikQ8BU47 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
E330017A01RikQ8BU47 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E330017A01RikQ8BU47 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E330017A01RikQ8BU47 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E330017A01RikQ8BU47 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
E330017A01RikQ8BU47 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E330017A01RikQ8BU47 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E330017A01RikQ8BU47 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E330017A01RikQ8BU47 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
E330017A01RikQ8BU47 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
E330017A01RikQ8BU47 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
E330017A01RikQ8BU47 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E330017A01RikQ8BU47 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E330017A01RikQ8BU47 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E330017A01RikQ8BU47 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E330017A01RikQ8BU47 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
E330017A01RikQ8BU47 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E330017A01RikQ8BU47 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E330017A01RikQ8BU47 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E330017A01RikQ8BU47 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E330017A01RikQ8BU47 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E330017A01RikQ8BU47 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E330017A01RikQ8BU47 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E330017A01RikQ8BU47 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
E330017A01RikQ8BU47 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E330017A01RikQ8BU47 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
E330017A01RikQ8BU47 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
E330017A01RikQ8BU47 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
E330017A01RikQ8BU47 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
E330017A01RikQ8BU47 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
E330017A01RikQ8BU47 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E330017A01RikQ8BU47 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E330017A01RikQ8BU47 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms