Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSD5

She, SH2 domain-containing adapter protein E, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SheQ8BSD5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SheQ8BSD5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SheQ8BSD5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SheQ8BSD5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SheQ8BSD5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SheQ8BSD5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SheQ8BSD5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SheQ8BSD5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SheQ8BSD5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SheQ8BSD5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SheQ8BSD5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SheQ8BSD5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SheQ8BSD5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SheQ8BSD5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SheQ8BSD5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SheQ8BSD5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SheQ8BSD5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SheQ8BSD5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SheQ8BSD5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SheQ8BSD5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SheQ8BSD5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SheQ8BSD5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SheQ8BSD5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SheQ8BSD5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SheQ8BSD5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SheQ8BSD5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SheQ8BSD5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SheQ8BSD5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SheQ8BSD5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SheQ8BSD5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SheQ8BSD5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SheQ8BSD5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SheQ8BSD5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SheQ8BSD5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SheQ8BSD5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SheQ8BSD5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SheQ8BSD5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SheQ8BSD5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SheQ8BSD5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SheQ8BSD5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SheQ8BSD5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SheQ8BSD5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SheQ8BSD5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SheQ8BSD5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SheQ8BSD5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SheQ8BSD5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SheQ8BSD5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SheQ8BSD5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SheQ8BSD5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SheQ8BSD5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SheQ8BSD5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SheQ8BSD5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SheQ8BSD5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SheQ8BSD5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SheQ8BSD5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SheQ8BSD5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SheQ8BSD5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SheQ8BSD5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SheQ8BSD5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SheQ8BSD5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SheQ8BSD5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SheQ8BSD5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SheQ8BSD5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SheQ8BSD5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SheQ8BSD5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SheQ8BSD5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SheQ8BSD5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SheQ8BSD5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SheQ8BSD5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SheQ8BSD5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SheQ8BSD5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SheQ8BSD5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SheQ8BSD5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SheQ8BSD5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SheQ8BSD5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SheQ8BSD5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SheQ8BSD5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SheQ8BSD5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SheQ8BSD5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SheQ8BSD5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SheQ8BSD5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SheQ8BSD5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SheQ8BSD5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SheQ8BSD5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SheQ8BSD5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SheQ8BSD5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SheQ8BSD5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SheQ8BSD5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SheQ8BSD5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SheQ8BSD5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SheQ8BSD5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SheQ8BSD5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SheQ8BSD5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SheQ8BSD5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SheQ8BSD5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SheQ8BSD5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SheQ8BSD5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SheQ8BSD5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SheQ8BSD5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SheQ8BSD5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms