Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJA2

Slc41a1, Solute carrier family 41 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc41a1Q8BJA2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc41a1Q8BJA2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc41a1Q8BJA2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc41a1Q8BJA2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc41a1Q8BJA2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc41a1Q8BJA2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc41a1Q8BJA2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc41a1Q8BJA2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc41a1Q8BJA2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc41a1Q8BJA2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc41a1Q8BJA2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc41a1Q8BJA2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc41a1Q8BJA2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc41a1Q8BJA2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc41a1Q8BJA2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc41a1Q8BJA2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc41a1Q8BJA2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc41a1Q8BJA2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc41a1Q8BJA2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc41a1Q8BJA2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc41a1Q8BJA2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc41a1Q8BJA2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc41a1Q8BJA2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc41a1Q8BJA2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc41a1Q8BJA2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc41a1Q8BJA2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc41a1Q8BJA2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc41a1Q8BJA2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc41a1Q8BJA2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc41a1Q8BJA2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc41a1Q8BJA2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc41a1Q8BJA2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc41a1Q8BJA2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc41a1Q8BJA2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc41a1Q8BJA2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc41a1Q8BJA2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc41a1Q8BJA2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc41a1Q8BJA2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc41a1Q8BJA2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc41a1Q8BJA2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc41a1Q8BJA2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc41a1Q8BJA2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc41a1Q8BJA2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc41a1Q8BJA2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc41a1Q8BJA2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc41a1Q8BJA2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc41a1Q8BJA2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc41a1Q8BJA2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc41a1Q8BJA2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc41a1Q8BJA2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc41a1Q8BJA2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc41a1Q8BJA2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Slc41a1Q8BJA2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc41a1Q8BJA2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc41a1Q8BJA2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc41a1Q8BJA2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc41a1Q8BJA2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc41a1Q8BJA2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc41a1Q8BJA2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc41a1Q8BJA2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc41a1Q8BJA2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc41a1Q8BJA2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc41a1Q8BJA2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc41a1Q8BJA2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc41a1Q8BJA2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc41a1Q8BJA2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc41a1Q8BJA2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc41a1Q8BJA2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc41a1Q8BJA2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc41a1Q8BJA2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc41a1Q8BJA2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc41a1Q8BJA2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc41a1Q8BJA2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc41a1Q8BJA2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc41a1Q8BJA2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc41a1Q8BJA2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc41a1Q8BJA2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc41a1Q8BJA2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc41a1Q8BJA2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc41a1Q8BJA2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc41a1Q8BJA2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc41a1Q8BJA2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Slc41a1Q8BJA2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Slc41a1Q8BJA2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc41a1Q8BJA2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc41a1Q8BJA2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc41a1Q8BJA2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc41a1Q8BJA2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc41a1Q8BJA2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc41a1Q8BJA2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc41a1Q8BJA2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc41a1Q8BJA2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc41a1Q8BJA2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc41a1Q8BJA2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc41a1Q8BJA2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc41a1Q8BJA2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc41a1Q8BJA2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc41a1Q8BJA2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc41a1Q8BJA2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc41a1Q8BJA2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms