Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGW3

Bhlhe23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe23Q8BGW3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bhlhe23Q8BGW3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bhlhe23Q8BGW3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Bhlhe23Q8BGW3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Bhlhe23Q8BGW3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bhlhe23Q8BGW3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bhlhe23Q8BGW3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bhlhe23Q8BGW3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bhlhe23Q8BGW3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bhlhe23Q8BGW3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bhlhe23Q8BGW3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bhlhe23Q8BGW3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bhlhe23Q8BGW3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bhlhe23Q8BGW3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bhlhe23Q8BGW3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bhlhe23Q8BGW3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bhlhe23Q8BGW3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bhlhe23Q8BGW3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bhlhe23Q8BGW3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bhlhe23Q8BGW3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bhlhe23Q8BGW3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bhlhe23Q8BGW3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bhlhe23Q8BGW3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bhlhe23Q8BGW3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Bhlhe23Q8BGW3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bhlhe23Q8BGW3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bhlhe23Q8BGW3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bhlhe23Q8BGW3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bhlhe23Q8BGW3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bhlhe23Q8BGW3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bhlhe23Q8BGW3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bhlhe23Q8BGW3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bhlhe23Q8BGW3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bhlhe23Q8BGW3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bhlhe23Q8BGW3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bhlhe23Q8BGW3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Bhlhe23Q8BGW3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bhlhe23Q8BGW3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bhlhe23Q8BGW3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bhlhe23Q8BGW3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bhlhe23Q8BGW3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bhlhe23Q8BGW3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bhlhe23Q8BGW3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bhlhe23Q8BGW3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bhlhe23Q8BGW3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bhlhe23Q8BGW3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bhlhe23Q8BGW3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Bhlhe23Q8BGW3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Bhlhe23Q8BGW3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Bhlhe23Q8BGW3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Bhlhe23Q8BGW3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Bhlhe23Q8BGW3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bhlhe23Q8BGW3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bhlhe23Q8BGW3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bhlhe23Q8BGW3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bhlhe23Q8BGW3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bhlhe23Q8BGW3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bhlhe23Q8BGW3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bhlhe23Q8BGW3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Bhlhe23Q8BGW3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Bhlhe23Q8BGW3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Bhlhe23Q8BGW3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Bhlhe23Q8BGW3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Bhlhe23Q8BGW3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Bhlhe23Q8BGW3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Bhlhe23Q8BGW3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bhlhe23Q8BGW3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bhlhe23Q8BGW3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bhlhe23Q8BGW3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bhlhe23Q8BGW3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bhlhe23Q8BGW3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Bhlhe23Q8BGW3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Bhlhe23Q8BGW3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Bhlhe23Q8BGW3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Bhlhe23Q8BGW3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Bhlhe23Q8BGW3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Bhlhe23Q8BGW3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bhlhe23Q8BGW3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bhlhe23Q8BGW3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bhlhe23Q8BGW3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bhlhe23Q8BGW3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bhlhe23Q8BGW3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bhlhe23Q8BGW3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bhlhe23Q8BGW3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bhlhe23Q8BGW3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bhlhe23Q8BGW3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bhlhe23Q8BGW3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bhlhe23Q8BGW3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bhlhe23Q8BGW3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bhlhe23Q8BGW3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bhlhe23Q8BGW3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bhlhe23Q8BGW3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bhlhe23Q8BGW3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bhlhe23Q8BGW3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bhlhe23Q8BGW3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bhlhe23Q8BGW3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bhlhe23Q8BGW3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bhlhe23Q8BGW3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bhlhe23Q8BGW3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bhlhe23Q8BGW3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms