Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cyp4f39Q8BGU0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cyp4f39Q8BGU0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cyp4f39Q8BGU0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cyp4f39Q8BGU0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cyp4f39Q8BGU0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cyp4f39Q8BGU0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cyp4f39Q8BGU0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cyp4f39Q8BGU0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cyp4f39Q8BGU0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cyp4f39Q8BGU0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cyp4f39Q8BGU0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cyp4f39Q8BGU0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cyp4f39Q8BGU0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Cyp4f39Q8BGU0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cyp4f39Q8BGU0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cyp4f39Q8BGU0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cyp4f39Q8BGU0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cyp4f39Q8BGU0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cyp4f39Q8BGU0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cyp4f39Q8BGU0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cyp4f39Q8BGU0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cyp4f39Q8BGU0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cyp4f39Q8BGU0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cyp4f39Q8BGU0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cyp4f39Q8BGU0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cyp4f39Q8BGU0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cyp4f39Q8BGU0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cyp4f39Q8BGU0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cyp4f39Q8BGU0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cyp4f39Q8BGU0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cyp4f39Q8BGU0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cyp4f39Q8BGU0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cyp4f39Q8BGU0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cyp4f39Q8BGU0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Cyp4f39Q8BGU0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cyp4f39Q8BGU0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cyp4f39Q8BGU0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cyp4f39Q8BGU0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Cyp4f39Q8BGU0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cyp4f39Q8BGU0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cyp4f39Q8BGU0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cyp4f39Q8BGU0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cyp4f39Q8BGU0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cyp4f39Q8BGU0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cyp4f39Q8BGU0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Cyp4f39Q8BGU0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cyp4f39Q8BGU0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cyp4f39Q8BGU0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Cyp4f39Q8BGU0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cyp4f39Q8BGU0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cyp4f39Q8BGU0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cyp4f39Q8BGU0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cyp4f39Q8BGU0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cyp4f39Q8BGU0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cyp4f39Q8BGU0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cyp4f39Q8BGU0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cyp4f39Q8BGU0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cyp4f39Q8BGU0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cyp4f39Q8BGU0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cyp4f39Q8BGU0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cyp4f39Q8BGU0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cyp4f39Q8BGU0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cyp4f39Q8BGU0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cyp4f39Q8BGU0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cyp4f39Q8BGU0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cyp4f39Q8BGU0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Cyp4f39Q8BGU0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cyp4f39Q8BGU0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cyp4f39Q8BGU0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cyp4f39Q8BGU0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cyp4f39Q8BGU0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cyp4f39Q8BGU0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Cyp4f39Q8BGU0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyp4f39Q8BGU0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyp4f39Q8BGU0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyp4f39Q8BGU0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyp4f39Q8BGU0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyp4f39Q8BGU0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyp4f39Q8BGU0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyp4f39Q8BGU0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyp4f39Q8BGU0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyp4f39Q8BGU0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cyp4f39Q8BGU0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cyp4f39Q8BGU0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cyp4f39Q8BGU0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cyp4f39Q8BGU0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cyp4f39Q8BGU0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cyp4f39Q8BGU0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cyp4f39Q8BGU0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cyp4f39Q8BGU0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cyp4f39Q8BGU0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cyp4f39Q8BGU0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cyp4f39Q8BGU0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cyp4f39Q8BGU0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cyp4f39Q8BGU0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cyp4f39Q8BGU0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Cyp4f39Q8BGU0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms