Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-M10.4Q85ZW8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
H2-M10.4Q85ZW8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
H2-M10.4Q85ZW8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2-M10.4Q85ZW8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
H2-M10.4Q85ZW8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
H2-M10.4Q85ZW8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2-M10.4Q85ZW8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
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H2-M10.4Q85ZW8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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H2-M10.4Q85ZW8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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H2-M10.4Q85ZW8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2-M10.4Q85ZW8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2-M10.4Q85ZW8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2-M10.4Q85ZW8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
H2-M10.4Q85ZW8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2-M10.4Q85ZW8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
H2-M10.4Q85ZW8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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