Protein–RNA interactions for Protein: Q80W85

Npm2, Nucleoplasmin-2, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm2Q80W85 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Npm2Q80W85 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Npm2Q80W85 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Npm2Q80W85 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Npm2Q80W85 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Npm2Q80W85 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Npm2Q80W85 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Npm2Q80W85 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Npm2Q80W85 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Npm2Q80W85 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Npm2Q80W85 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Npm2Q80W85 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Npm2Q80W85 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Npm2Q80W85 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Npm2Q80W85 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Npm2Q80W85 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Npm2Q80W85 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Npm2Q80W85 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Npm2Q80W85 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Npm2Q80W85 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Npm2Q80W85 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Npm2Q80W85 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Npm2Q80W85 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Npm2Q80W85 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
Npm2Q80W85 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Npm2Q80W85 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Npm2Q80W85 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Npm2Q80W85 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Npm2Q80W85 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Npm2Q80W85 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Npm2Q80W85 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Npm2Q80W85 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.24
Npm2Q80W85 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
Npm2Q80W85 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC35.26■■■■□ 3.23
Npm2Q80W85 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Npm2Q80W85 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Npm2Q80W85 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Npm2Q80W85 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Npm2Q80W85 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Npm2Q80W85 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
Npm2Q80W85 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Npm2Q80W85 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
Npm2Q80W85 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Npm2Q80W85 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Npm2Q80W85 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Npm2Q80W85 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
Npm2Q80W85 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC35.19■■■■□ 3.22
Npm2Q80W85 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
Npm2Q80W85 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Npm2Q80W85 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Npm2Q80W85 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Npm2Q80W85 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Npm2Q80W85 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Npm2Q80W85 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Npm2Q80W85 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Npm2Q80W85 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Npm2Q80W85 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Npm2Q80W85 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Npm2Q80W85 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Npm2Q80W85 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Npm2Q80W85 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Npm2Q80W85 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Npm2Q80W85 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
Npm2Q80W85 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Npm2Q80W85 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Npm2Q80W85 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Npm2Q80W85 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Npm2Q80W85 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Npm2Q80W85 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Npm2Q80W85 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Npm2Q80W85 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Npm2Q80W85 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Npm2Q80W85 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Npm2Q80W85 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Npm2Q80W85 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Npm2Q80W85 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Npm2Q80W85 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Npm2Q80W85 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Npm2Q80W85 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Npm2Q80W85 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Npm2Q80W85 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Npm2Q80W85 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
Npm2Q80W85 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
Npm2Q80W85 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Npm2Q80W85 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
Npm2Q80W85 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Npm2Q80W85 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Npm2Q80W85 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Npm2Q80W85 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Npm2Q80W85 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Npm2Q80W85 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Npm2Q80W85 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
Npm2Q80W85 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Npm2Q80W85 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Npm2Q80W85 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
Npm2Q80W85 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Npm2Q80W85 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Npm2Q80W85 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Npm2Q80W85 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Npm2Q80W85 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms