Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pnma8aQ80VM8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pnma8aQ80VM8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pnma8aQ80VM8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pnma8aQ80VM8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pnma8aQ80VM8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pnma8aQ80VM8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pnma8aQ80VM8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pnma8aQ80VM8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pnma8aQ80VM8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pnma8aQ80VM8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pnma8aQ80VM8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pnma8aQ80VM8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pnma8aQ80VM8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pnma8aQ80VM8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pnma8aQ80VM8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pnma8aQ80VM8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pnma8aQ80VM8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pnma8aQ80VM8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pnma8aQ80VM8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pnma8aQ80VM8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pnma8aQ80VM8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pnma8aQ80VM8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pnma8aQ80VM8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pnma8aQ80VM8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pnma8aQ80VM8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pnma8aQ80VM8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pnma8aQ80VM8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pnma8aQ80VM8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pnma8aQ80VM8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pnma8aQ80VM8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pnma8aQ80VM8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pnma8aQ80VM8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pnma8aQ80VM8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pnma8aQ80VM8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pnma8aQ80VM8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Pnma8aQ80VM8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pnma8aQ80VM8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pnma8aQ80VM8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pnma8aQ80VM8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pnma8aQ80VM8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pnma8aQ80VM8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pnma8aQ80VM8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Pnma8aQ80VM8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pnma8aQ80VM8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pnma8aQ80VM8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pnma8aQ80VM8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pnma8aQ80VM8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pnma8aQ80VM8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pnma8aQ80VM8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pnma8aQ80VM8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pnma8aQ80VM8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pnma8aQ80VM8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pnma8aQ80VM8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pnma8aQ80VM8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Pnma8aQ80VM8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pnma8aQ80VM8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pnma8aQ80VM8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pnma8aQ80VM8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pnma8aQ80VM8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pnma8aQ80VM8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pnma8aQ80VM8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pnma8aQ80VM8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pnma8aQ80VM8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pnma8aQ80VM8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pnma8aQ80VM8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pnma8aQ80VM8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pnma8aQ80VM8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pnma8aQ80VM8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pnma8aQ80VM8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pnma8aQ80VM8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pnma8aQ80VM8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pnma8aQ80VM8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pnma8aQ80VM8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pnma8aQ80VM8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Pnma8aQ80VM8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pnma8aQ80VM8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pnma8aQ80VM8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pnma8aQ80VM8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pnma8aQ80VM8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pnma8aQ80VM8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pnma8aQ80VM8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pnma8aQ80VM8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pnma8aQ80VM8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pnma8aQ80VM8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pnma8aQ80VM8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pnma8aQ80VM8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pnma8aQ80VM8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pnma8aQ80VM8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pnma8aQ80VM8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pnma8aQ80VM8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pnma8aQ80VM8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pnma8aQ80VM8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pnma8aQ80VM8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pnma8aQ80VM8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pnma8aQ80VM8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pnma8aQ80VM8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pnma8aQ80VM8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pnma8aQ80VM8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pnma8aQ80VM8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms