Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pnma8aQ80VM8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pnma8aQ80VM8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pnma8aQ80VM8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pnma8aQ80VM8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pnma8aQ80VM8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pnma8aQ80VM8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pnma8aQ80VM8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pnma8aQ80VM8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pnma8aQ80VM8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pnma8aQ80VM8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pnma8aQ80VM8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pnma8aQ80VM8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pnma8aQ80VM8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pnma8aQ80VM8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pnma8aQ80VM8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pnma8aQ80VM8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pnma8aQ80VM8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pnma8aQ80VM8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pnma8aQ80VM8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pnma8aQ80VM8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pnma8aQ80VM8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pnma8aQ80VM8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pnma8aQ80VM8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pnma8aQ80VM8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pnma8aQ80VM8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pnma8aQ80VM8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pnma8aQ80VM8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pnma8aQ80VM8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pnma8aQ80VM8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pnma8aQ80VM8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pnma8aQ80VM8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pnma8aQ80VM8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pnma8aQ80VM8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pnma8aQ80VM8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pnma8aQ80VM8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Pnma8aQ80VM8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pnma8aQ80VM8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pnma8aQ80VM8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pnma8aQ80VM8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pnma8aQ80VM8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pnma8aQ80VM8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pnma8aQ80VM8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Pnma8aQ80VM8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pnma8aQ80VM8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pnma8aQ80VM8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pnma8aQ80VM8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pnma8aQ80VM8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pnma8aQ80VM8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pnma8aQ80VM8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pnma8aQ80VM8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pnma8aQ80VM8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pnma8aQ80VM8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pnma8aQ80VM8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pnma8aQ80VM8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Pnma8aQ80VM8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pnma8aQ80VM8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pnma8aQ80VM8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pnma8aQ80VM8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pnma8aQ80VM8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pnma8aQ80VM8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pnma8aQ80VM8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pnma8aQ80VM8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pnma8aQ80VM8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pnma8aQ80VM8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pnma8aQ80VM8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pnma8aQ80VM8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pnma8aQ80VM8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pnma8aQ80VM8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pnma8aQ80VM8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pnma8aQ80VM8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pnma8aQ80VM8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pnma8aQ80VM8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pnma8aQ80VM8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pnma8aQ80VM8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Pnma8aQ80VM8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pnma8aQ80VM8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pnma8aQ80VM8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pnma8aQ80VM8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pnma8aQ80VM8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pnma8aQ80VM8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pnma8aQ80VM8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pnma8aQ80VM8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pnma8aQ80VM8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pnma8aQ80VM8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pnma8aQ80VM8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pnma8aQ80VM8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pnma8aQ80VM8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pnma8aQ80VM8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pnma8aQ80VM8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pnma8aQ80VM8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pnma8aQ80VM8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pnma8aQ80VM8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pnma8aQ80VM8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pnma8aQ80VM8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pnma8aQ80VM8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pnma8aQ80VM8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pnma8aQ80VM8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pnma8aQ80VM8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pnma8aQ80VM8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms