Protein–RNA interactions for Protein: Q78PY7

Snd1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snd1Q78PY7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snd1Q78PY7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snd1Q78PY7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snd1Q78PY7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Snd1Q78PY7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snd1Q78PY7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snd1Q78PY7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snd1Q78PY7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snd1Q78PY7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snd1Q78PY7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snd1Q78PY7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snd1Q78PY7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snd1Q78PY7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Snd1Q78PY7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snd1Q78PY7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snd1Q78PY7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snd1Q78PY7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snd1Q78PY7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snd1Q78PY7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snd1Q78PY7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snd1Q78PY7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snd1Q78PY7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snd1Q78PY7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snd1Q78PY7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snd1Q78PY7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snd1Q78PY7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snd1Q78PY7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snd1Q78PY7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snd1Q78PY7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snd1Q78PY7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snd1Q78PY7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snd1Q78PY7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snd1Q78PY7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snd1Q78PY7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snd1Q78PY7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snd1Q78PY7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Snd1Q78PY7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snd1Q78PY7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snd1Q78PY7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snd1Q78PY7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snd1Q78PY7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Snd1Q78PY7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snd1Q78PY7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snd1Q78PY7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snd1Q78PY7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snd1Q78PY7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snd1Q78PY7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snd1Q78PY7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snd1Q78PY7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snd1Q78PY7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snd1Q78PY7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snd1Q78PY7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Snd1Q78PY7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Snd1Q78PY7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snd1Q78PY7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snd1Q78PY7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snd1Q78PY7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snd1Q78PY7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snd1Q78PY7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snd1Q78PY7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Snd1Q78PY7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snd1Q78PY7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snd1Q78PY7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snd1Q78PY7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snd1Q78PY7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Snd1Q78PY7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snd1Q78PY7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snd1Q78PY7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snd1Q78PY7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snd1Q78PY7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snd1Q78PY7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snd1Q78PY7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Snd1Q78PY7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snd1Q78PY7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Snd1Q78PY7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Snd1Q78PY7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Snd1Q78PY7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snd1Q78PY7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snd1Q78PY7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snd1Q78PY7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snd1Q78PY7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snd1Q78PY7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snd1Q78PY7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snd1Q78PY7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snd1Q78PY7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snd1Q78PY7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snd1Q78PY7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snd1Q78PY7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snd1Q78PY7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snd1Q78PY7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snd1Q78PY7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Snd1Q78PY7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Snd1Q78PY7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Snd1Q78PY7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snd1Q78PY7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snd1Q78PY7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snd1Q78PY7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snd1Q78PY7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snd1Q78PY7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snd1Q78PY7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms