Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nme8Q715T0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nme8Q715T0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Nme8Q715T0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nme8Q715T0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nme8Q715T0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nme8Q715T0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nme8Q715T0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Nme8Q715T0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nme8Q715T0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nme8Q715T0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nme8Q715T0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nme8Q715T0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nme8Q715T0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nme8Q715T0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nme8Q715T0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nme8Q715T0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nme8Q715T0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nme8Q715T0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nme8Q715T0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nme8Q715T0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nme8Q715T0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nme8Q715T0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nme8Q715T0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nme8Q715T0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nme8Q715T0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nme8Q715T0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Nme8Q715T0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nme8Q715T0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nme8Q715T0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nme8Q715T0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nme8Q715T0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nme8Q715T0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nme8Q715T0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nme8Q715T0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nme8Q715T0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nme8Q715T0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nme8Q715T0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Nme8Q715T0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nme8Q715T0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nme8Q715T0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nme8Q715T0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nme8Q715T0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nme8Q715T0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nme8Q715T0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nme8Q715T0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nme8Q715T0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nme8Q715T0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nme8Q715T0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nme8Q715T0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nme8Q715T0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nme8Q715T0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nme8Q715T0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nme8Q715T0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nme8Q715T0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nme8Q715T0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nme8Q715T0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nme8Q715T0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nme8Q715T0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nme8Q715T0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nme8Q715T0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nme8Q715T0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Nme8Q715T0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Nme8Q715T0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nme8Q715T0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Nme8Q715T0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nme8Q715T0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nme8Q715T0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nme8Q715T0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nme8Q715T0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nme8Q715T0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nme8Q715T0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nme8Q715T0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nme8Q715T0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nme8Q715T0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nme8Q715T0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nme8Q715T0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nme8Q715T0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nme8Q715T0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nme8Q715T0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nme8Q715T0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nme8Q715T0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nme8Q715T0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nme8Q715T0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nme8Q715T0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nme8Q715T0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Nme8Q715T0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Nme8Q715T0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Nme8Q715T0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Nme8Q715T0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nme8Q715T0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Nme8Q715T0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nme8Q715T0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Nme8Q715T0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nme8Q715T0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nme8Q715T0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nme8Q715T0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nme8Q715T0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nme8Q715T0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nme8Q715T0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms