Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQE4

Nemp1, Nuclear envelope integral membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nemp1Q6ZQE4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nemp1Q6ZQE4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nemp1Q6ZQE4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nemp1Q6ZQE4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nemp1Q6ZQE4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nemp1Q6ZQE4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nemp1Q6ZQE4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nemp1Q6ZQE4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nemp1Q6ZQE4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nemp1Q6ZQE4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nemp1Q6ZQE4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nemp1Q6ZQE4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nemp1Q6ZQE4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nemp1Q6ZQE4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nemp1Q6ZQE4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nemp1Q6ZQE4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nemp1Q6ZQE4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nemp1Q6ZQE4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nemp1Q6ZQE4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nemp1Q6ZQE4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nemp1Q6ZQE4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Nemp1Q6ZQE4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nemp1Q6ZQE4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nemp1Q6ZQE4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nemp1Q6ZQE4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nemp1Q6ZQE4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nemp1Q6ZQE4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nemp1Q6ZQE4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nemp1Q6ZQE4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nemp1Q6ZQE4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nemp1Q6ZQE4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nemp1Q6ZQE4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nemp1Q6ZQE4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nemp1Q6ZQE4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nemp1Q6ZQE4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nemp1Q6ZQE4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nemp1Q6ZQE4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nemp1Q6ZQE4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nemp1Q6ZQE4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nemp1Q6ZQE4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nemp1Q6ZQE4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Nemp1Q6ZQE4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nemp1Q6ZQE4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nemp1Q6ZQE4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nemp1Q6ZQE4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Nemp1Q6ZQE4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Nemp1Q6ZQE4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nemp1Q6ZQE4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nemp1Q6ZQE4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nemp1Q6ZQE4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nemp1Q6ZQE4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nemp1Q6ZQE4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nemp1Q6ZQE4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nemp1Q6ZQE4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nemp1Q6ZQE4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nemp1Q6ZQE4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nemp1Q6ZQE4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nemp1Q6ZQE4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nemp1Q6ZQE4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nemp1Q6ZQE4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nemp1Q6ZQE4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nemp1Q6ZQE4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nemp1Q6ZQE4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nemp1Q6ZQE4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nemp1Q6ZQE4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nemp1Q6ZQE4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nemp1Q6ZQE4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nemp1Q6ZQE4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Nemp1Q6ZQE4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nemp1Q6ZQE4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nemp1Q6ZQE4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nemp1Q6ZQE4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nemp1Q6ZQE4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nemp1Q6ZQE4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nemp1Q6ZQE4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nemp1Q6ZQE4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nemp1Q6ZQE4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nemp1Q6ZQE4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nemp1Q6ZQE4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nemp1Q6ZQE4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nemp1Q6ZQE4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nemp1Q6ZQE4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nemp1Q6ZQE4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nemp1Q6ZQE4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Nemp1Q6ZQE4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nemp1Q6ZQE4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nemp1Q6ZQE4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nemp1Q6ZQE4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nemp1Q6ZQE4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nemp1Q6ZQE4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nemp1Q6ZQE4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nemp1Q6ZQE4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nemp1Q6ZQE4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nemp1Q6ZQE4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nemp1Q6ZQE4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nemp1Q6ZQE4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Nemp1Q6ZQE4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nemp1Q6ZQE4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nemp1Q6ZQE4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nemp1Q6ZQE4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms