Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2P8

Neil2, Endonuclease 8-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil2Q6R2P8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Neil2Q6R2P8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Neil2Q6R2P8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Neil2Q6R2P8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Neil2Q6R2P8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Neil2Q6R2P8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Neil2Q6R2P8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Neil2Q6R2P8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Neil2Q6R2P8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Neil2Q6R2P8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Neil2Q6R2P8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Neil2Q6R2P8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Neil2Q6R2P8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Neil2Q6R2P8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Neil2Q6R2P8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Neil2Q6R2P8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Neil2Q6R2P8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Neil2Q6R2P8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Neil2Q6R2P8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Neil2Q6R2P8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Neil2Q6R2P8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Neil2Q6R2P8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Neil2Q6R2P8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Neil2Q6R2P8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Neil2Q6R2P8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Neil2Q6R2P8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Neil2Q6R2P8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Neil2Q6R2P8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Neil2Q6R2P8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Neil2Q6R2P8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Neil2Q6R2P8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Neil2Q6R2P8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Neil2Q6R2P8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Neil2Q6R2P8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Neil2Q6R2P8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Neil2Q6R2P8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Neil2Q6R2P8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Neil2Q6R2P8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Neil2Q6R2P8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Neil2Q6R2P8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Neil2Q6R2P8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Neil2Q6R2P8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Neil2Q6R2P8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Neil2Q6R2P8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Neil2Q6R2P8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Neil2Q6R2P8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Neil2Q6R2P8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Neil2Q6R2P8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Neil2Q6R2P8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Neil2Q6R2P8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Neil2Q6R2P8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Neil2Q6R2P8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Neil2Q6R2P8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Neil2Q6R2P8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Neil2Q6R2P8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Neil2Q6R2P8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Neil2Q6R2P8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Neil2Q6R2P8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Neil2Q6R2P8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Neil2Q6R2P8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Neil2Q6R2P8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Neil2Q6R2P8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Neil2Q6R2P8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Neil2Q6R2P8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Neil2Q6R2P8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Neil2Q6R2P8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Neil2Q6R2P8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Neil2Q6R2P8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Neil2Q6R2P8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Neil2Q6R2P8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Neil2Q6R2P8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Neil2Q6R2P8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Neil2Q6R2P8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Neil2Q6R2P8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Neil2Q6R2P8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Neil2Q6R2P8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Neil2Q6R2P8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Neil2Q6R2P8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Neil2Q6R2P8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Neil2Q6R2P8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Neil2Q6R2P8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Neil2Q6R2P8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Neil2Q6R2P8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Neil2Q6R2P8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Neil2Q6R2P8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Neil2Q6R2P8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Neil2Q6R2P8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Neil2Q6R2P8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Neil2Q6R2P8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Neil2Q6R2P8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Neil2Q6R2P8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Neil2Q6R2P8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Neil2Q6R2P8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Neil2Q6R2P8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Neil2Q6R2P8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Neil2Q6R2P8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Neil2Q6R2P8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Neil2Q6R2P8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Neil2Q6R2P8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Neil2Q6R2P8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms