Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mfsd13aQ6PDE8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mfsd13aQ6PDE8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mfsd13aQ6PDE8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mfsd13aQ6PDE8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mfsd13aQ6PDE8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mfsd13aQ6PDE8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mfsd13aQ6PDE8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mfsd13aQ6PDE8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mfsd13aQ6PDE8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mfsd13aQ6PDE8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mfsd13aQ6PDE8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mfsd13aQ6PDE8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mfsd13aQ6PDE8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mfsd13aQ6PDE8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mfsd13aQ6PDE8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mfsd13aQ6PDE8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mfsd13aQ6PDE8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mfsd13aQ6PDE8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mfsd13aQ6PDE8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mfsd13aQ6PDE8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mfsd13aQ6PDE8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mfsd13aQ6PDE8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mfsd13aQ6PDE8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mfsd13aQ6PDE8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mfsd13aQ6PDE8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mfsd13aQ6PDE8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mfsd13aQ6PDE8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mfsd13aQ6PDE8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mfsd13aQ6PDE8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mfsd13aQ6PDE8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mfsd13aQ6PDE8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mfsd13aQ6PDE8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mfsd13aQ6PDE8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mfsd13aQ6PDE8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mfsd13aQ6PDE8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mfsd13aQ6PDE8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Mfsd13aQ6PDE8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mfsd13aQ6PDE8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mfsd13aQ6PDE8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mfsd13aQ6PDE8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mfsd13aQ6PDE8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mfsd13aQ6PDE8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mfsd13aQ6PDE8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mfsd13aQ6PDE8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mfsd13aQ6PDE8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mfsd13aQ6PDE8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mfsd13aQ6PDE8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Mfsd13aQ6PDE8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mfsd13aQ6PDE8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mfsd13aQ6PDE8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mfsd13aQ6PDE8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mfsd13aQ6PDE8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Mfsd13aQ6PDE8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mfsd13aQ6PDE8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mfsd13aQ6PDE8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mfsd13aQ6PDE8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mfsd13aQ6PDE8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mfsd13aQ6PDE8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mfsd13aQ6PDE8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mfsd13aQ6PDE8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mfsd13aQ6PDE8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mfsd13aQ6PDE8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mfsd13aQ6PDE8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mfsd13aQ6PDE8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Mfsd13aQ6PDE8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mfsd13aQ6PDE8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mfsd13aQ6PDE8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mfsd13aQ6PDE8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mfsd13aQ6PDE8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mfsd13aQ6PDE8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mfsd13aQ6PDE8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mfsd13aQ6PDE8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mfsd13aQ6PDE8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mfsd13aQ6PDE8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mfsd13aQ6PDE8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mfsd13aQ6PDE8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mfsd13aQ6PDE8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mfsd13aQ6PDE8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mfsd13aQ6PDE8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mfsd13aQ6PDE8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mfsd13aQ6PDE8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mfsd13aQ6PDE8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mfsd13aQ6PDE8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mfsd13aQ6PDE8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mfsd13aQ6PDE8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mfsd13aQ6PDE8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mfsd13aQ6PDE8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mfsd13aQ6PDE8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mfsd13aQ6PDE8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mfsd13aQ6PDE8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mfsd13aQ6PDE8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mfsd13aQ6PDE8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mfsd13aQ6PDE8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mfsd13aQ6PDE8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Mfsd13aQ6PDE8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mfsd13aQ6PDE8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.8 ms