Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAQ4

Rexo4, RNA exonuclease 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo4Q6PAQ4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rexo4Q6PAQ4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rexo4Q6PAQ4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rexo4Q6PAQ4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rexo4Q6PAQ4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rexo4Q6PAQ4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rexo4Q6PAQ4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rexo4Q6PAQ4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rexo4Q6PAQ4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rexo4Q6PAQ4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rexo4Q6PAQ4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rexo4Q6PAQ4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rexo4Q6PAQ4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rexo4Q6PAQ4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rexo4Q6PAQ4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rexo4Q6PAQ4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rexo4Q6PAQ4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rexo4Q6PAQ4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rexo4Q6PAQ4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rexo4Q6PAQ4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rexo4Q6PAQ4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rexo4Q6PAQ4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rexo4Q6PAQ4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rexo4Q6PAQ4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rexo4Q6PAQ4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rexo4Q6PAQ4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rexo4Q6PAQ4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rexo4Q6PAQ4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rexo4Q6PAQ4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rexo4Q6PAQ4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rexo4Q6PAQ4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rexo4Q6PAQ4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rexo4Q6PAQ4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rexo4Q6PAQ4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rexo4Q6PAQ4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rexo4Q6PAQ4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rexo4Q6PAQ4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rexo4Q6PAQ4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rexo4Q6PAQ4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rexo4Q6PAQ4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rexo4Q6PAQ4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rexo4Q6PAQ4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rexo4Q6PAQ4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rexo4Q6PAQ4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rexo4Q6PAQ4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rexo4Q6PAQ4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rexo4Q6PAQ4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rexo4Q6PAQ4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rexo4Q6PAQ4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rexo4Q6PAQ4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rexo4Q6PAQ4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rexo4Q6PAQ4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rexo4Q6PAQ4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rexo4Q6PAQ4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rexo4Q6PAQ4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rexo4Q6PAQ4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rexo4Q6PAQ4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rexo4Q6PAQ4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rexo4Q6PAQ4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rexo4Q6PAQ4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rexo4Q6PAQ4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rexo4Q6PAQ4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rexo4Q6PAQ4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rexo4Q6PAQ4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rexo4Q6PAQ4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rexo4Q6PAQ4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rexo4Q6PAQ4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rexo4Q6PAQ4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rexo4Q6PAQ4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rexo4Q6PAQ4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rexo4Q6PAQ4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rexo4Q6PAQ4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rexo4Q6PAQ4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rexo4Q6PAQ4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rexo4Q6PAQ4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rexo4Q6PAQ4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Rexo4Q6PAQ4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rexo4Q6PAQ4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rexo4Q6PAQ4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Rexo4Q6PAQ4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rexo4Q6PAQ4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rexo4Q6PAQ4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rexo4Q6PAQ4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rexo4Q6PAQ4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rexo4Q6PAQ4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rexo4Q6PAQ4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rexo4Q6PAQ4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rexo4Q6PAQ4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rexo4Q6PAQ4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rexo4Q6PAQ4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rexo4Q6PAQ4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rexo4Q6PAQ4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rexo4Q6PAQ4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rexo4Q6PAQ4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rexo4Q6PAQ4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Rexo4Q6PAQ4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rexo4Q6PAQ4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Rexo4Q6PAQ4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rexo4Q6PAQ4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rexo4Q6PAQ4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms