Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smchd1Q6P5D8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smchd1Q6P5D8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smchd1Q6P5D8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Smchd1Q6P5D8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smchd1Q6P5D8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smchd1Q6P5D8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smchd1Q6P5D8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smchd1Q6P5D8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smchd1Q6P5D8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Smchd1Q6P5D8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smchd1Q6P5D8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Smchd1Q6P5D8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smchd1Q6P5D8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smchd1Q6P5D8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smchd1Q6P5D8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smchd1Q6P5D8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smchd1Q6P5D8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smchd1Q6P5D8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smchd1Q6P5D8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smchd1Q6P5D8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smchd1Q6P5D8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smchd1Q6P5D8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smchd1Q6P5D8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smchd1Q6P5D8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smchd1Q6P5D8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smchd1Q6P5D8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smchd1Q6P5D8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smchd1Q6P5D8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smchd1Q6P5D8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smchd1Q6P5D8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smchd1Q6P5D8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smchd1Q6P5D8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smchd1Q6P5D8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smchd1Q6P5D8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smchd1Q6P5D8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smchd1Q6P5D8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smchd1Q6P5D8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smchd1Q6P5D8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smchd1Q6P5D8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smchd1Q6P5D8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smchd1Q6P5D8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Smchd1Q6P5D8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smchd1Q6P5D8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smchd1Q6P5D8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smchd1Q6P5D8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smchd1Q6P5D8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smchd1Q6P5D8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smchd1Q6P5D8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smchd1Q6P5D8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smchd1Q6P5D8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smchd1Q6P5D8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Smchd1Q6P5D8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smchd1Q6P5D8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smchd1Q6P5D8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smchd1Q6P5D8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smchd1Q6P5D8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smchd1Q6P5D8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smchd1Q6P5D8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smchd1Q6P5D8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smchd1Q6P5D8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smchd1Q6P5D8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smchd1Q6P5D8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smchd1Q6P5D8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smchd1Q6P5D8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smchd1Q6P5D8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smchd1Q6P5D8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smchd1Q6P5D8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smchd1Q6P5D8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Smchd1Q6P5D8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smchd1Q6P5D8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smchd1Q6P5D8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smchd1Q6P5D8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smchd1Q6P5D8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smchd1Q6P5D8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smchd1Q6P5D8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smchd1Q6P5D8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Smchd1Q6P5D8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Smchd1Q6P5D8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Smchd1Q6P5D8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smchd1Q6P5D8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smchd1Q6P5D8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smchd1Q6P5D8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smchd1Q6P5D8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smchd1Q6P5D8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smchd1Q6P5D8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smchd1Q6P5D8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smchd1Q6P5D8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smchd1Q6P5D8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smchd1Q6P5D8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smchd1Q6P5D8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smchd1Q6P5D8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smchd1Q6P5D8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smchd1Q6P5D8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smchd1Q6P5D8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smchd1Q6P5D8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smchd1Q6P5D8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smchd1Q6P5D8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smchd1Q6P5D8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Smchd1Q6P5D8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 885.5 ms