Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3B9

Rbfa, Putative ribosome-binding factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RbfaQ6P3B9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RbfaQ6P3B9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RbfaQ6P3B9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RbfaQ6P3B9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RbfaQ6P3B9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RbfaQ6P3B9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RbfaQ6P3B9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RbfaQ6P3B9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RbfaQ6P3B9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RbfaQ6P3B9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RbfaQ6P3B9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RbfaQ6P3B9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RbfaQ6P3B9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RbfaQ6P3B9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RbfaQ6P3B9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RbfaQ6P3B9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RbfaQ6P3B9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RbfaQ6P3B9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RbfaQ6P3B9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RbfaQ6P3B9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RbfaQ6P3B9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RbfaQ6P3B9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RbfaQ6P3B9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RbfaQ6P3B9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RbfaQ6P3B9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RbfaQ6P3B9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RbfaQ6P3B9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RbfaQ6P3B9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RbfaQ6P3B9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RbfaQ6P3B9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RbfaQ6P3B9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RbfaQ6P3B9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RbfaQ6P3B9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RbfaQ6P3B9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RbfaQ6P3B9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RbfaQ6P3B9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RbfaQ6P3B9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RbfaQ6P3B9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RbfaQ6P3B9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RbfaQ6P3B9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RbfaQ6P3B9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RbfaQ6P3B9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RbfaQ6P3B9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RbfaQ6P3B9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RbfaQ6P3B9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RbfaQ6P3B9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RbfaQ6P3B9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RbfaQ6P3B9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RbfaQ6P3B9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RbfaQ6P3B9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RbfaQ6P3B9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RbfaQ6P3B9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RbfaQ6P3B9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RbfaQ6P3B9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RbfaQ6P3B9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RbfaQ6P3B9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RbfaQ6P3B9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RbfaQ6P3B9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RbfaQ6P3B9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RbfaQ6P3B9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RbfaQ6P3B9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RbfaQ6P3B9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RbfaQ6P3B9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RbfaQ6P3B9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RbfaQ6P3B9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RbfaQ6P3B9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RbfaQ6P3B9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RbfaQ6P3B9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RbfaQ6P3B9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RbfaQ6P3B9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RbfaQ6P3B9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RbfaQ6P3B9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RbfaQ6P3B9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RbfaQ6P3B9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RbfaQ6P3B9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RbfaQ6P3B9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RbfaQ6P3B9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RbfaQ6P3B9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RbfaQ6P3B9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RbfaQ6P3B9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RbfaQ6P3B9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RbfaQ6P3B9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RbfaQ6P3B9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RbfaQ6P3B9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RbfaQ6P3B9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RbfaQ6P3B9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RbfaQ6P3B9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RbfaQ6P3B9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RbfaQ6P3B9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RbfaQ6P3B9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RbfaQ6P3B9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RbfaQ6P3B9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RbfaQ6P3B9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RbfaQ6P3B9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RbfaQ6P3B9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RbfaQ6P3B9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RbfaQ6P3B9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RbfaQ6P3B9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RbfaQ6P3B9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RbfaQ6P3B9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms