Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1C6

Lrig3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig3Q6P1C6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrig3Q6P1C6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrig3Q6P1C6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrig3Q6P1C6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrig3Q6P1C6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrig3Q6P1C6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrig3Q6P1C6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrig3Q6P1C6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrig3Q6P1C6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrig3Q6P1C6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrig3Q6P1C6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrig3Q6P1C6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrig3Q6P1C6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrig3Q6P1C6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrig3Q6P1C6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrig3Q6P1C6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrig3Q6P1C6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrig3Q6P1C6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrig3Q6P1C6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrig3Q6P1C6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrig3Q6P1C6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrig3Q6P1C6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrig3Q6P1C6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrig3Q6P1C6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrig3Q6P1C6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrig3Q6P1C6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrig3Q6P1C6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrig3Q6P1C6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrig3Q6P1C6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrig3Q6P1C6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrig3Q6P1C6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrig3Q6P1C6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrig3Q6P1C6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrig3Q6P1C6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrig3Q6P1C6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrig3Q6P1C6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrig3Q6P1C6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrig3Q6P1C6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrig3Q6P1C6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrig3Q6P1C6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrig3Q6P1C6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrig3Q6P1C6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrig3Q6P1C6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrig3Q6P1C6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrig3Q6P1C6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrig3Q6P1C6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrig3Q6P1C6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrig3Q6P1C6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrig3Q6P1C6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrig3Q6P1C6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrig3Q6P1C6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrig3Q6P1C6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrig3Q6P1C6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrig3Q6P1C6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrig3Q6P1C6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrig3Q6P1C6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrig3Q6P1C6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrig3Q6P1C6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrig3Q6P1C6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrig3Q6P1C6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrig3Q6P1C6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrig3Q6P1C6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrig3Q6P1C6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrig3Q6P1C6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrig3Q6P1C6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrig3Q6P1C6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrig3Q6P1C6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrig3Q6P1C6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrig3Q6P1C6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrig3Q6P1C6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrig3Q6P1C6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrig3Q6P1C6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrig3Q6P1C6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrig3Q6P1C6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrig3Q6P1C6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrig3Q6P1C6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrig3Q6P1C6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrig3Q6P1C6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrig3Q6P1C6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrig3Q6P1C6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrig3Q6P1C6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrig3Q6P1C6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrig3Q6P1C6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lrig3Q6P1C6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrig3Q6P1C6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrig3Q6P1C6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrig3Q6P1C6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrig3Q6P1C6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrig3Q6P1C6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrig3Q6P1C6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrig3Q6P1C6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrig3Q6P1C6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrig3Q6P1C6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrig3Q6P1C6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrig3Q6P1C6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrig3Q6P1C6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrig3Q6P1C6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrig3Q6P1C6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrig3Q6P1C6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrig3Q6P1C6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms