Protein–RNA interactions for Protein: Q6NV83

U2surp, U2 snRNP-associated SURP motif-containing protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2surpQ6NV83 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
U2surpQ6NV83 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
U2surpQ6NV83 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
U2surpQ6NV83 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
U2surpQ6NV83 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
U2surpQ6NV83 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
U2surpQ6NV83 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
U2surpQ6NV83 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
U2surpQ6NV83 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
U2surpQ6NV83 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
U2surpQ6NV83 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
U2surpQ6NV83 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
U2surpQ6NV83 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
U2surpQ6NV83 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
U2surpQ6NV83 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
U2surpQ6NV83 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
U2surpQ6NV83 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
U2surpQ6NV83 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
U2surpQ6NV83 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
U2surpQ6NV83 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
U2surpQ6NV83 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
U2surpQ6NV83 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
U2surpQ6NV83 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
U2surpQ6NV83 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
U2surpQ6NV83 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
U2surpQ6NV83 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
U2surpQ6NV83 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
U2surpQ6NV83 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
U2surpQ6NV83 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
U2surpQ6NV83 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
U2surpQ6NV83 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
U2surpQ6NV83 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
U2surpQ6NV83 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
U2surpQ6NV83 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
U2surpQ6NV83 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
U2surpQ6NV83 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
U2surpQ6NV83 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
U2surpQ6NV83 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
U2surpQ6NV83 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
U2surpQ6NV83 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
U2surpQ6NV83 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
U2surpQ6NV83 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
U2surpQ6NV83 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
U2surpQ6NV83 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
U2surpQ6NV83 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
U2surpQ6NV83 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
U2surpQ6NV83 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
U2surpQ6NV83 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
U2surpQ6NV83 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
U2surpQ6NV83 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
U2surpQ6NV83 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
U2surpQ6NV83 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
U2surpQ6NV83 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
U2surpQ6NV83 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
U2surpQ6NV83 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
U2surpQ6NV83 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
U2surpQ6NV83 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
U2surpQ6NV83 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
U2surpQ6NV83 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
U2surpQ6NV83 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
U2surpQ6NV83 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
U2surpQ6NV83 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
U2surpQ6NV83 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
U2surpQ6NV83 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
U2surpQ6NV83 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
U2surpQ6NV83 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
U2surpQ6NV83 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
U2surpQ6NV83 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
U2surpQ6NV83 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
U2surpQ6NV83 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
U2surpQ6NV83 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
U2surpQ6NV83 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
U2surpQ6NV83 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
U2surpQ6NV83 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
U2surpQ6NV83 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
U2surpQ6NV83 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
U2surpQ6NV83 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
U2surpQ6NV83 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
U2surpQ6NV83 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
U2surpQ6NV83 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
U2surpQ6NV83 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
U2surpQ6NV83 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
U2surpQ6NV83 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
U2surpQ6NV83 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
U2surpQ6NV83 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
U2surpQ6NV83 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
U2surpQ6NV83 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
U2surpQ6NV83 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
U2surpQ6NV83 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
U2surpQ6NV83 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
U2surpQ6NV83 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
U2surpQ6NV83 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
U2surpQ6NV83 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
U2surpQ6NV83 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
U2surpQ6NV83 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
U2surpQ6NV83 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
U2surpQ6NV83 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
U2surpQ6NV83 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
U2surpQ6NV83 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
U2surpQ6NV83 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms