Protein–RNA interactions for Protein: Q6A026

Pds5a, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pds5aQ6A026 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pds5aQ6A026 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pds5aQ6A026 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pds5aQ6A026 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pds5aQ6A026 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pds5aQ6A026 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pds5aQ6A026 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pds5aQ6A026 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pds5aQ6A026 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pds5aQ6A026 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pds5aQ6A026 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pds5aQ6A026 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pds5aQ6A026 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pds5aQ6A026 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pds5aQ6A026 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pds5aQ6A026 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pds5aQ6A026 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pds5aQ6A026 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pds5aQ6A026 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pds5aQ6A026 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pds5aQ6A026 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Pds5aQ6A026 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pds5aQ6A026 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pds5aQ6A026 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pds5aQ6A026 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pds5aQ6A026 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pds5aQ6A026 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pds5aQ6A026 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pds5aQ6A026 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pds5aQ6A026 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pds5aQ6A026 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pds5aQ6A026 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pds5aQ6A026 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pds5aQ6A026 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pds5aQ6A026 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pds5aQ6A026 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pds5aQ6A026 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pds5aQ6A026 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pds5aQ6A026 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pds5aQ6A026 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pds5aQ6A026 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pds5aQ6A026 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pds5aQ6A026 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pds5aQ6A026 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pds5aQ6A026 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Pds5aQ6A026 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pds5aQ6A026 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pds5aQ6A026 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pds5aQ6A026 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pds5aQ6A026 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pds5aQ6A026 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pds5aQ6A026 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pds5aQ6A026 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pds5aQ6A026 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pds5aQ6A026 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pds5aQ6A026 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pds5aQ6A026 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pds5aQ6A026 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pds5aQ6A026 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pds5aQ6A026 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Pds5aQ6A026 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pds5aQ6A026 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pds5aQ6A026 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Pds5aQ6A026 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pds5aQ6A026 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pds5aQ6A026 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pds5aQ6A026 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pds5aQ6A026 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pds5aQ6A026 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pds5aQ6A026 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pds5aQ6A026 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pds5aQ6A026 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pds5aQ6A026 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pds5aQ6A026 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pds5aQ6A026 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pds5aQ6A026 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pds5aQ6A026 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pds5aQ6A026 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pds5aQ6A026 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pds5aQ6A026 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pds5aQ6A026 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Pds5aQ6A026 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pds5aQ6A026 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pds5aQ6A026 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pds5aQ6A026 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pds5aQ6A026 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pds5aQ6A026 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pds5aQ6A026 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pds5aQ6A026 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Pds5aQ6A026 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pds5aQ6A026 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pds5aQ6A026 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pds5aQ6A026 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pds5aQ6A026 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pds5aQ6A026 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pds5aQ6A026 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pds5aQ6A026 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pds5aQ6A026 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Pds5aQ6A026 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pds5aQ6A026 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms