Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Pan3Q640Q5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pan3Q640Q5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pan3Q640Q5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pan3Q640Q5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pan3Q640Q5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pan3Q640Q5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Pan3Q640Q5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pan3Q640Q5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pan3Q640Q5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pan3Q640Q5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pan3Q640Q5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pan3Q640Q5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pan3Q640Q5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pan3Q640Q5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Pan3Q640Q5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Pan3Q640Q5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pan3Q640Q5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pan3Q640Q5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pan3Q640Q5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Pan3Q640Q5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pan3Q640Q5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pan3Q640Q5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pan3Q640Q5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pan3Q640Q5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Pan3Q640Q5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pan3Q640Q5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pan3Q640Q5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pan3Q640Q5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pan3Q640Q5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pan3Q640Q5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pan3Q640Q5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pan3Q640Q5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pan3Q640Q5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pan3Q640Q5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pan3Q640Q5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pan3Q640Q5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Pan3Q640Q5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pan3Q640Q5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pan3Q640Q5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pan3Q640Q5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Pan3Q640Q5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pan3Q640Q5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pan3Q640Q5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pan3Q640Q5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pan3Q640Q5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pan3Q640Q5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pan3Q640Q5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pan3Q640Q5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pan3Q640Q5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pan3Q640Q5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Pan3Q640Q5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pan3Q640Q5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pan3Q640Q5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Pan3Q640Q5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Pan3Q640Q5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pan3Q640Q5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pan3Q640Q5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Pan3Q640Q5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pan3Q640Q5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pan3Q640Q5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pan3Q640Q5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pan3Q640Q5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pan3Q640Q5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pan3Q640Q5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pan3Q640Q5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Pan3Q640Q5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
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Pan3Q640Q5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pan3Q640Q5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pan3Q640Q5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pan3Q640Q5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pan3Q640Q5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pan3Q640Q5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pan3Q640Q5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pan3Q640Q5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pan3Q640Q5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Pan3Q640Q5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pan3Q640Q5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pan3Q640Q5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pan3Q640Q5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pan3Q640Q5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pan3Q640Q5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pan3Q640Q5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pan3Q640Q5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pan3Q640Q5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pan3Q640Q5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pan3Q640Q5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pan3Q640Q5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pan3Q640Q5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pan3Q640Q5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pan3Q640Q5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pan3Q640Q5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pan3Q640Q5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pan3Q640Q5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Pan3Q640Q5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pan3Q640Q5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pan3Q640Q5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pan3Q640Q5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pan3Q640Q5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms