Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Sall3Q62255 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Sall3Q62255 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
Sall3Q62255 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Sall3Q62255 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Sall3Q62255 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Sall3Q62255 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Sall3Q62255 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Sall3Q62255 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
Sall3Q62255 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Sall3Q62255 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Sall3Q62255 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Sall3Q62255 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Sall3Q62255 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
Sall3Q62255 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Sall3Q62255 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Sall3Q62255 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Sall3Q62255 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Sall3Q62255 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Sall3Q62255 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Sall3Q62255 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Sall3Q62255 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Sall3Q62255 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Sall3Q62255 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Sall3Q62255 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
Sall3Q62255 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Sall3Q62255 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Sall3Q62255 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Sall3Q62255 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
Sall3Q62255 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Sall3Q62255 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Sall3Q62255 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Sall3Q62255 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Sall3Q62255 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Sall3Q62255 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Sall3Q62255 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Sall3Q62255 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Sall3Q62255 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Sall3Q62255 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Sall3Q62255 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Sall3Q62255 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Sall3Q62255 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Sall3Q62255 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
Sall3Q62255 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Sall3Q62255 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Sall3Q62255 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Sall3Q62255 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Sall3Q62255 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
Sall3Q62255 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Sall3Q62255 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Sall3Q62255 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Sall3Q62255 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Sall3Q62255 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Sall3Q62255 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
Sall3Q62255 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Sall3Q62255 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Sall3Q62255 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Sall3Q62255 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Sall3Q62255 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Sall3Q62255 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
Sall3Q62255 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Sall3Q62255 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Sall3Q62255 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Sall3Q62255 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Sall3Q62255 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Sall3Q62255 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Sall3Q62255 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Sall3Q62255 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC31■■■□□ 2.55
Sall3Q62255 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
Sall3Q62255 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Sall3Q62255 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Sall3Q62255 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Sall3Q62255 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Sall3Q62255 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Sall3Q62255 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
Sall3Q62255 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Sall3Q62255 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Sall3Q62255 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Sall3Q62255 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Sall3Q62255 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Sall3Q62255 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Sall3Q62255 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Sall3Q62255 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Sall3Q62255 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Sall3Q62255 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Sall3Q62255 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Sall3Q62255 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Sall3Q62255 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
Sall3Q62255 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
Sall3Q62255 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.54
Sall3Q62255 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Sall3Q62255 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Sall3Q62255 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Sall3Q62255 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Sall3Q62255 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Sall3Q62255 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Sall3Q62255 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Sall3Q62255 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Sall3Q62255 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Sall3Q62255 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms