Protein–RNA interactions for Protein: Q61626

Grik5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik5Q61626 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Grik5Q61626 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Grik5Q61626 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Grik5Q61626 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Grik5Q61626 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Grik5Q61626 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Grik5Q61626 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Grik5Q61626 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Grik5Q61626 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Grik5Q61626 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Grik5Q61626 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Grik5Q61626 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Grik5Q61626 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Grik5Q61626 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Grik5Q61626 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Grik5Q61626 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Grik5Q61626 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Grik5Q61626 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Grik5Q61626 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Grik5Q61626 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Grik5Q61626 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Grik5Q61626 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Grik5Q61626 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Grik5Q61626 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Grik5Q61626 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Grik5Q61626 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Grik5Q61626 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Grik5Q61626 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Grik5Q61626 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Grik5Q61626 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Grik5Q61626 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Grik5Q61626 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Grik5Q61626 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Grik5Q61626 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Grik5Q61626 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Grik5Q61626 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Grik5Q61626 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Grik5Q61626 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Grik5Q61626 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Grik5Q61626 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Grik5Q61626 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Grik5Q61626 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Grik5Q61626 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Grik5Q61626 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Grik5Q61626 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Grik5Q61626 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Grik5Q61626 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Grik5Q61626 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Grik5Q61626 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Grik5Q61626 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Grik5Q61626 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Grik5Q61626 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Grik5Q61626 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Grik5Q61626 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Grik5Q61626 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Grik5Q61626 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Grik5Q61626 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Grik5Q61626 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Grik5Q61626 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Grik5Q61626 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Grik5Q61626 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Grik5Q61626 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Grik5Q61626 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Grik5Q61626 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Grik5Q61626 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Grik5Q61626 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Grik5Q61626 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Grik5Q61626 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Grik5Q61626 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Grik5Q61626 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Grik5Q61626 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Grik5Q61626 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Grik5Q61626 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Grik5Q61626 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Grik5Q61626 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Grik5Q61626 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Grik5Q61626 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Grik5Q61626 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Grik5Q61626 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Grik5Q61626 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Grik5Q61626 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Grik5Q61626 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Grik5Q61626 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Grik5Q61626 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Grik5Q61626 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Grik5Q61626 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Grik5Q61626 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Grik5Q61626 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Grik5Q61626 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Grik5Q61626 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Grik5Q61626 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Grik5Q61626 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Grik5Q61626 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Grik5Q61626 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Grik5Q61626 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Grik5Q61626 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Grik5Q61626 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Grik5Q61626 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Grik5Q61626 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Grik5Q61626 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 162.5 ms