Protein–RNA interactions for Protein: Q61510

Trim25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim25Q61510 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim25Q61510 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim25Q61510 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim25Q61510 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim25Q61510 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim25Q61510 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim25Q61510 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim25Q61510 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim25Q61510 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim25Q61510 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim25Q61510 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim25Q61510 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim25Q61510 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim25Q61510 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim25Q61510 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim25Q61510 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim25Q61510 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim25Q61510 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim25Q61510 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim25Q61510 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim25Q61510 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim25Q61510 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim25Q61510 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim25Q61510 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim25Q61510 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim25Q61510 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim25Q61510 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim25Q61510 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim25Q61510 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim25Q61510 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim25Q61510 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim25Q61510 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim25Q61510 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim25Q61510 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim25Q61510 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim25Q61510 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim25Q61510 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim25Q61510 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Trim25Q61510 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Trim25Q61510 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Trim25Q61510 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim25Q61510 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim25Q61510 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim25Q61510 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim25Q61510 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim25Q61510 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim25Q61510 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim25Q61510 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim25Q61510 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim25Q61510 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim25Q61510 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim25Q61510 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim25Q61510 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim25Q61510 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim25Q61510 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim25Q61510 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim25Q61510 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim25Q61510 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim25Q61510 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim25Q61510 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim25Q61510 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim25Q61510 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim25Q61510 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim25Q61510 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim25Q61510 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim25Q61510 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trim25Q61510 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim25Q61510 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim25Q61510 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim25Q61510 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim25Q61510 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim25Q61510 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim25Q61510 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim25Q61510 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim25Q61510 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim25Q61510 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim25Q61510 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim25Q61510 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim25Q61510 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim25Q61510 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim25Q61510 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim25Q61510 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim25Q61510 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim25Q61510 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim25Q61510 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim25Q61510 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim25Q61510 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim25Q61510 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim25Q61510 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim25Q61510 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim25Q61510 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim25Q61510 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim25Q61510 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trim25Q61510 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim25Q61510 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim25Q61510 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim25Q61510 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim25Q61510 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim25Q61510 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim25Q61510 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.4 ms