Protein–RNA interactions for Protein: Q61450

Gp49a, Mast cell surface glycoprotein Gp49A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp49aQ61450 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gp49aQ61450 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gp49aQ61450 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gp49aQ61450 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gp49aQ61450 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gp49aQ61450 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gp49aQ61450 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gp49aQ61450 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gp49aQ61450 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gp49aQ61450 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gp49aQ61450 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gp49aQ61450 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gp49aQ61450 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gp49aQ61450 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gp49aQ61450 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gp49aQ61450 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gp49aQ61450 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gp49aQ61450 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gp49aQ61450 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gp49aQ61450 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gp49aQ61450 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gp49aQ61450 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gp49aQ61450 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gp49aQ61450 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gp49aQ61450 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gp49aQ61450 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gp49aQ61450 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gp49aQ61450 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gp49aQ61450 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gp49aQ61450 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gp49aQ61450 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gp49aQ61450 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gp49aQ61450 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gp49aQ61450 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gp49aQ61450 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gp49aQ61450 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gp49aQ61450 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gp49aQ61450 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gp49aQ61450 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gp49aQ61450 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gp49aQ61450 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gp49aQ61450 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gp49aQ61450 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gp49aQ61450 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gp49aQ61450 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gp49aQ61450 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gp49aQ61450 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gp49aQ61450 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gp49aQ61450 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gp49aQ61450 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gp49aQ61450 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gp49aQ61450 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gp49aQ61450 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gp49aQ61450 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gp49aQ61450 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gp49aQ61450 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gp49aQ61450 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gp49aQ61450 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gp49aQ61450 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gp49aQ61450 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gp49aQ61450 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gp49aQ61450 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gp49aQ61450 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gp49aQ61450 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gp49aQ61450 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gp49aQ61450 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gp49aQ61450 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gp49aQ61450 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gp49aQ61450 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gp49aQ61450 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gp49aQ61450 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gp49aQ61450 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gp49aQ61450 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gp49aQ61450 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gp49aQ61450 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gp49aQ61450 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gp49aQ61450 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gp49aQ61450 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gp49aQ61450 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gp49aQ61450 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gp49aQ61450 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gp49aQ61450 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gp49aQ61450 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gp49aQ61450 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gp49aQ61450 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gp49aQ61450 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gp49aQ61450 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gp49aQ61450 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gp49aQ61450 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gp49aQ61450 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gp49aQ61450 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gp49aQ61450 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gp49aQ61450 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gp49aQ61450 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gp49aQ61450 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gp49aQ61450 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gp49aQ61450 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gp49aQ61450 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gp49aQ61450 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gp49aQ61450 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms