Protein–RNA interactions for Protein: Q61371

Ift88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift88Q61371 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ift88Q61371 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ift88Q61371 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ift88Q61371 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ift88Q61371 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ift88Q61371 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ift88Q61371 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ift88Q61371 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ift88Q61371 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ift88Q61371 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ift88Q61371 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ift88Q61371 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ift88Q61371 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ift88Q61371 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ift88Q61371 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ift88Q61371 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ift88Q61371 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ift88Q61371 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ift88Q61371 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ift88Q61371 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ift88Q61371 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ift88Q61371 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ift88Q61371 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ift88Q61371 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ift88Q61371 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ift88Q61371 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ift88Q61371 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ift88Q61371 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ift88Q61371 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ift88Q61371 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ift88Q61371 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ift88Q61371 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ift88Q61371 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ift88Q61371 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ift88Q61371 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ift88Q61371 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ift88Q61371 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ift88Q61371 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ift88Q61371 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ift88Q61371 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ift88Q61371 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ift88Q61371 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ift88Q61371 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ift88Q61371 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ift88Q61371 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ift88Q61371 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ift88Q61371 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ift88Q61371 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Ift88Q61371 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ift88Q61371 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Ift88Q61371 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ift88Q61371 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ift88Q61371 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ift88Q61371 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ift88Q61371 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ift88Q61371 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ift88Q61371 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ift88Q61371 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ift88Q61371 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ift88Q61371 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ift88Q61371 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ift88Q61371 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ift88Q61371 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ift88Q61371 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ift88Q61371 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ift88Q61371 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ift88Q61371 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ift88Q61371 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ift88Q61371 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ift88Q61371 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ift88Q61371 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ift88Q61371 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ift88Q61371 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ift88Q61371 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ift88Q61371 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ift88Q61371 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ift88Q61371 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ift88Q61371 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ift88Q61371 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ift88Q61371 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ift88Q61371 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ift88Q61371 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ift88Q61371 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ift88Q61371 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ift88Q61371 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ift88Q61371 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ift88Q61371 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ift88Q61371 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ift88Q61371 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ift88Q61371 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ift88Q61371 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ift88Q61371 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ift88Q61371 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ift88Q61371 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ift88Q61371 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ift88Q61371 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ift88Q61371 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ift88Q61371 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ift88Q61371 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ift88Q61371 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms