Protein–RNA interactions for Protein: Q61137

Astn1, Astrotactin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Astn1Q61137 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Astn1Q61137 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Astn1Q61137 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Astn1Q61137 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Astn1Q61137 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Astn1Q61137 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Astn1Q61137 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Astn1Q61137 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Astn1Q61137 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Astn1Q61137 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Astn1Q61137 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Astn1Q61137 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Astn1Q61137 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Astn1Q61137 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Astn1Q61137 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Astn1Q61137 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Astn1Q61137 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Astn1Q61137 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Astn1Q61137 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Astn1Q61137 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Astn1Q61137 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Astn1Q61137 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Astn1Q61137 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Astn1Q61137 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Astn1Q61137 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Astn1Q61137 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Astn1Q61137 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Astn1Q61137 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Astn1Q61137 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Astn1Q61137 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Astn1Q61137 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Astn1Q61137 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Astn1Q61137 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Astn1Q61137 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Astn1Q61137 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Astn1Q61137 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Astn1Q61137 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Astn1Q61137 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Astn1Q61137 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Astn1Q61137 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Astn1Q61137 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Astn1Q61137 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Astn1Q61137 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Astn1Q61137 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Astn1Q61137 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Astn1Q61137 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Astn1Q61137 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Astn1Q61137 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Astn1Q61137 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Astn1Q61137 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Astn1Q61137 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Astn1Q61137 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Astn1Q61137 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Astn1Q61137 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Astn1Q61137 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Astn1Q61137 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Astn1Q61137 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Astn1Q61137 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Astn1Q61137 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Astn1Q61137 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Astn1Q61137 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Astn1Q61137 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Astn1Q61137 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Astn1Q61137 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Astn1Q61137 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Astn1Q61137 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Astn1Q61137 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Astn1Q61137 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Astn1Q61137 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Astn1Q61137 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Astn1Q61137 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Astn1Q61137 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Astn1Q61137 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Astn1Q61137 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Astn1Q61137 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Astn1Q61137 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Astn1Q61137 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Astn1Q61137 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Astn1Q61137 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Astn1Q61137 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Astn1Q61137 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Astn1Q61137 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Astn1Q61137 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Astn1Q61137 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Astn1Q61137 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Astn1Q61137 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Astn1Q61137 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Astn1Q61137 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Astn1Q61137 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Astn1Q61137 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Astn1Q61137 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Astn1Q61137 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Astn1Q61137 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Astn1Q61137 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Astn1Q61137 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Astn1Q61137 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Astn1Q61137 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Astn1Q61137 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Astn1Q61137 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Astn1Q61137 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms