Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tnfrsf8Q60846 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tnfrsf8Q60846 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tnfrsf8Q60846 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tnfrsf8Q60846 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tnfrsf8Q60846 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Tnfrsf8Q60846 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tnfrsf8Q60846 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnfrsf8Q60846 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnfrsf8Q60846 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnfrsf8Q60846 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnfrsf8Q60846 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnfrsf8Q60846 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnfrsf8Q60846 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnfrsf8Q60846 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnfrsf8Q60846 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnfrsf8Q60846 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnfrsf8Q60846 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnfrsf8Q60846 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnfrsf8Q60846 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnfrsf8Q60846 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnfrsf8Q60846 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnfrsf8Q60846 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnfrsf8Q60846 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnfrsf8Q60846 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnfrsf8Q60846 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnfrsf8Q60846 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnfrsf8Q60846 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnfrsf8Q60846 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnfrsf8Q60846 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnfrsf8Q60846 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnfrsf8Q60846 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnfrsf8Q60846 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnfrsf8Q60846 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnfrsf8Q60846 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnfrsf8Q60846 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnfrsf8Q60846 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnfrsf8Q60846 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnfrsf8Q60846 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnfrsf8Q60846 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnfrsf8Q60846 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnfrsf8Q60846 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tnfrsf8Q60846 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnfrsf8Q60846 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnfrsf8Q60846 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnfrsf8Q60846 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnfrsf8Q60846 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnfrsf8Q60846 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnfrsf8Q60846 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnfrsf8Q60846 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnfrsf8Q60846 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnfrsf8Q60846 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnfrsf8Q60846 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnfrsf8Q60846 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnfrsf8Q60846 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnfrsf8Q60846 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnfrsf8Q60846 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnfrsf8Q60846 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnfrsf8Q60846 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnfrsf8Q60846 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnfrsf8Q60846 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnfrsf8Q60846 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnfrsf8Q60846 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnfrsf8Q60846 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnfrsf8Q60846 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnfrsf8Q60846 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnfrsf8Q60846 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnfrsf8Q60846 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfrsf8Q60846 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfrsf8Q60846 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfrsf8Q60846 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfrsf8Q60846 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfrsf8Q60846 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnfrsf8Q60846 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnfrsf8Q60846 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnfrsf8Q60846 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnfrsf8Q60846 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnfrsf8Q60846 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnfrsf8Q60846 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnfrsf8Q60846 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnfrsf8Q60846 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnfrsf8Q60846 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnfrsf8Q60846 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnfrsf8Q60846 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnfrsf8Q60846 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnfrsf8Q60846 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnfrsf8Q60846 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnfrsf8Q60846 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnfrsf8Q60846 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnfrsf8Q60846 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnfrsf8Q60846 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnfrsf8Q60846 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnfrsf8Q60846 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnfrsf8Q60846 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnfrsf8Q60846 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnfrsf8Q60846 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnfrsf8Q60846 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnfrsf8Q60846 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnfrsf8Q60846 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnfrsf8Q60846 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms