Protein–RNA interactions for Protein: Q60692

Psmb6, Proteasome subunit beta type-6, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb6Q60692 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Psmb6Q60692 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psmb6Q60692 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Psmb6Q60692 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psmb6Q60692 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psmb6Q60692 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psmb6Q60692 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psmb6Q60692 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psmb6Q60692 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psmb6Q60692 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psmb6Q60692 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psmb6Q60692 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psmb6Q60692 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psmb6Q60692 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psmb6Q60692 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psmb6Q60692 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psmb6Q60692 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Psmb6Q60692 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psmb6Q60692 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psmb6Q60692 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psmb6Q60692 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psmb6Q60692 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Psmb6Q60692 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psmb6Q60692 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Psmb6Q60692 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psmb6Q60692 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psmb6Q60692 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psmb6Q60692 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psmb6Q60692 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psmb6Q60692 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psmb6Q60692 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psmb6Q60692 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psmb6Q60692 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psmb6Q60692 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psmb6Q60692 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psmb6Q60692 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psmb6Q60692 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb6Q60692 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb6Q60692 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb6Q60692 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb6Q60692 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb6Q60692 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb6Q60692 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb6Q60692 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb6Q60692 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb6Q60692 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb6Q60692 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb6Q60692 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psmb6Q60692 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psmb6Q60692 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psmb6Q60692 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psmb6Q60692 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psmb6Q60692 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psmb6Q60692 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psmb6Q60692 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psmb6Q60692 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Psmb6Q60692 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psmb6Q60692 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psmb6Q60692 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psmb6Q60692 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Psmb6Q60692 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Psmb6Q60692 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Psmb6Q60692 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psmb6Q60692 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psmb6Q60692 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psmb6Q60692 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Psmb6Q60692 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psmb6Q60692 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psmb6Q60692 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psmb6Q60692 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psmb6Q60692 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psmb6Q60692 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psmb6Q60692 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psmb6Q60692 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psmb6Q60692 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psmb6Q60692 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psmb6Q60692 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psmb6Q60692 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psmb6Q60692 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psmb6Q60692 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psmb6Q60692 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psmb6Q60692 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psmb6Q60692 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psmb6Q60692 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psmb6Q60692 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmb6Q60692 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmb6Q60692 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmb6Q60692 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmb6Q60692 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmb6Q60692 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmb6Q60692 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmb6Q60692 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmb6Q60692 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psmb6Q60692 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psmb6Q60692 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psmb6Q60692 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psmb6Q60692 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psmb6Q60692 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Psmb6Q60692 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psmb6Q60692 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms