Protein–RNA interactions for Protein: Q5XJY5

Arcn1, Coatomer subunit delta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Arcn1Q5XJY5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Arcn1Q5XJY5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Arcn1Q5XJY5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Arcn1Q5XJY5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Arcn1Q5XJY5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Arcn1Q5XJY5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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Arcn1Q5XJY5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Arcn1Q5XJY5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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Arcn1Q5XJY5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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Arcn1Q5XJY5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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Arcn1Q5XJY5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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Arcn1Q5XJY5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
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Arcn1Q5XJY5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Arcn1Q5XJY5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Arcn1Q5XJY5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
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Arcn1Q5XJY5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
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Arcn1Q5XJY5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Arcn1Q5XJY5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Arcn1Q5XJY5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
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Arcn1Q5XJY5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
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Arcn1Q5XJY5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
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Arcn1Q5XJY5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Arcn1Q5XJY5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Arcn1Q5XJY5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
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Arcn1Q5XJY5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Arcn1Q5XJY5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Arcn1Q5XJY5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Arcn1Q5XJY5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
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Arcn1Q5XJY5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Arcn1Q5XJY5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Arcn1Q5XJY5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Arcn1Q5XJY5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Arcn1Q5XJY5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Arcn1Q5XJY5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Arcn1Q5XJY5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms