Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim38Q5SZ99 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim38Q5SZ99 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim38Q5SZ99 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim38Q5SZ99 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim38Q5SZ99 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim38Q5SZ99 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim38Q5SZ99 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim38Q5SZ99 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim38Q5SZ99 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim38Q5SZ99 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim38Q5SZ99 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim38Q5SZ99 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim38Q5SZ99 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim38Q5SZ99 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim38Q5SZ99 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim38Q5SZ99 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim38Q5SZ99 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim38Q5SZ99 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim38Q5SZ99 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim38Q5SZ99 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim38Q5SZ99 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim38Q5SZ99 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim38Q5SZ99 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim38Q5SZ99 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim38Q5SZ99 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim38Q5SZ99 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim38Q5SZ99 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim38Q5SZ99 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim38Q5SZ99 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim38Q5SZ99 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim38Q5SZ99 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim38Q5SZ99 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim38Q5SZ99 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim38Q5SZ99 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim38Q5SZ99 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim38Q5SZ99 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim38Q5SZ99 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim38Q5SZ99 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim38Q5SZ99 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim38Q5SZ99 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim38Q5SZ99 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim38Q5SZ99 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim38Q5SZ99 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim38Q5SZ99 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim38Q5SZ99 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim38Q5SZ99 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim38Q5SZ99 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim38Q5SZ99 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim38Q5SZ99 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim38Q5SZ99 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim38Q5SZ99 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim38Q5SZ99 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim38Q5SZ99 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim38Q5SZ99 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim38Q5SZ99 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim38Q5SZ99 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim38Q5SZ99 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim38Q5SZ99 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim38Q5SZ99 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim38Q5SZ99 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim38Q5SZ99 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim38Q5SZ99 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim38Q5SZ99 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim38Q5SZ99 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim38Q5SZ99 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim38Q5SZ99 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim38Q5SZ99 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim38Q5SZ99 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim38Q5SZ99 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim38Q5SZ99 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim38Q5SZ99 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim38Q5SZ99 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim38Q5SZ99 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim38Q5SZ99 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim38Q5SZ99 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim38Q5SZ99 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim38Q5SZ99 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim38Q5SZ99 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim38Q5SZ99 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim38Q5SZ99 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim38Q5SZ99 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim38Q5SZ99 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim38Q5SZ99 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim38Q5SZ99 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim38Q5SZ99 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim38Q5SZ99 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim38Q5SZ99 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trim38Q5SZ99 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trim38Q5SZ99 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim38Q5SZ99 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim38Q5SZ99 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim38Q5SZ99 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim38Q5SZ99 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim38Q5SZ99 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim38Q5SZ99 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim38Q5SZ99 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim38Q5SZ99 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim38Q5SZ99 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim38Q5SZ99 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim38Q5SZ99 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
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