Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc42Q5SV66 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc42Q5SV66 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc42Q5SV66 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc42Q5SV66 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc42Q5SV66 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc42Q5SV66 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc42Q5SV66 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc42Q5SV66 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc42Q5SV66 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc42Q5SV66 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc42Q5SV66 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc42Q5SV66 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc42Q5SV66 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc42Q5SV66 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc42Q5SV66 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc42Q5SV66 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc42Q5SV66 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc42Q5SV66 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc42Q5SV66 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc42Q5SV66 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc42Q5SV66 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc42Q5SV66 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc42Q5SV66 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc42Q5SV66 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc42Q5SV66 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc42Q5SV66 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc42Q5SV66 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc42Q5SV66 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc42Q5SV66 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc42Q5SV66 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc42Q5SV66 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc42Q5SV66 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc42Q5SV66 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc42Q5SV66 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc42Q5SV66 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc42Q5SV66 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc42Q5SV66 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc42Q5SV66 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc42Q5SV66 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc42Q5SV66 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc42Q5SV66 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc42Q5SV66 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc42Q5SV66 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc42Q5SV66 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc42Q5SV66 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc42Q5SV66 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc42Q5SV66 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc42Q5SV66 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc42Q5SV66 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc42Q5SV66 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc42Q5SV66 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc42Q5SV66 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc42Q5SV66 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc42Q5SV66 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc42Q5SV66 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc42Q5SV66 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc42Q5SV66 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc42Q5SV66 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc42Q5SV66 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc42Q5SV66 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc42Q5SV66 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc42Q5SV66 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc42Q5SV66 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc42Q5SV66 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc42Q5SV66 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc42Q5SV66 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc42Q5SV66 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc42Q5SV66 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc42Q5SV66 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc42Q5SV66 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc42Q5SV66 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc42Q5SV66 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc42Q5SV66 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc42Q5SV66 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc42Q5SV66 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc42Q5SV66 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc42Q5SV66 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc42Q5SV66 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc42Q5SV66 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc42Q5SV66 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc42Q5SV66 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc42Q5SV66 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc42Q5SV66 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc42Q5SV66 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc42Q5SV66 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc42Q5SV66 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc42Q5SV66 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc42Q5SV66 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc42Q5SV66 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc42Q5SV66 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc42Q5SV66 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc42Q5SV66 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc42Q5SV66 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc42Q5SV66 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc42Q5SV66 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc42Q5SV66 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc42Q5SV66 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc42Q5SV66 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc42Q5SV66 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 147.9 ms