Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bbs12Q5SUD9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bbs12Q5SUD9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bbs12Q5SUD9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bbs12Q5SUD9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bbs12Q5SUD9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bbs12Q5SUD9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bbs12Q5SUD9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bbs12Q5SUD9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bbs12Q5SUD9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bbs12Q5SUD9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bbs12Q5SUD9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bbs12Q5SUD9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bbs12Q5SUD9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bbs12Q5SUD9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Bbs12Q5SUD9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bbs12Q5SUD9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bbs12Q5SUD9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bbs12Q5SUD9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bbs12Q5SUD9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Bbs12Q5SUD9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bbs12Q5SUD9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bbs12Q5SUD9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bbs12Q5SUD9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bbs12Q5SUD9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Bbs12Q5SUD9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bbs12Q5SUD9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bbs12Q5SUD9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bbs12Q5SUD9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bbs12Q5SUD9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Bbs12Q5SUD9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Bbs12Q5SUD9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Bbs12Q5SUD9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Bbs12Q5SUD9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Bbs12Q5SUD9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Bbs12Q5SUD9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Bbs12Q5SUD9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Bbs12Q5SUD9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Bbs12Q5SUD9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Bbs12Q5SUD9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Bbs12Q5SUD9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Bbs12Q5SUD9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Bbs12Q5SUD9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Bbs12Q5SUD9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Bbs12Q5SUD9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Bbs12Q5SUD9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Bbs12Q5SUD9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Bbs12Q5SUD9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Bbs12Q5SUD9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Bbs12Q5SUD9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Bbs12Q5SUD9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Bbs12Q5SUD9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Bbs12Q5SUD9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Bbs12Q5SUD9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Bbs12Q5SUD9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Bbs12Q5SUD9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Bbs12Q5SUD9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Bbs12Q5SUD9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Bbs12Q5SUD9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Bbs12Q5SUD9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Bbs12Q5SUD9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Bbs12Q5SUD9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Bbs12Q5SUD9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Bbs12Q5SUD9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Bbs12Q5SUD9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Bbs12Q5SUD9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Bbs12Q5SUD9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Bbs12Q5SUD9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Bbs12Q5SUD9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Bbs12Q5SUD9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Bbs12Q5SUD9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Bbs12Q5SUD9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Bbs12Q5SUD9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Bbs12Q5SUD9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Bbs12Q5SUD9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Bbs12Q5SUD9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Bbs12Q5SUD9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Bbs12Q5SUD9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Bbs12Q5SUD9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Bbs12Q5SUD9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Bbs12Q5SUD9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Bbs12Q5SUD9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Bbs12Q5SUD9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Bbs12Q5SUD9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Bbs12Q5SUD9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Bbs12Q5SUD9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Bbs12Q5SUD9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Bbs12Q5SUD9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Bbs12Q5SUD9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Bbs12Q5SUD9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Bbs12Q5SUD9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Bbs12Q5SUD9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Bbs12Q5SUD9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Bbs12Q5SUD9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Bbs12Q5SUD9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Bbs12Q5SUD9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Bbs12Q5SUD9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Bbs12Q5SUD9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Bbs12Q5SUD9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Bbs12Q5SUD9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms