Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSL4

Abr, Active breakpoint cluster region-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AbrQ5SSL4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AbrQ5SSL4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AbrQ5SSL4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AbrQ5SSL4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
AbrQ5SSL4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AbrQ5SSL4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AbrQ5SSL4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
AbrQ5SSL4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
AbrQ5SSL4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
AbrQ5SSL4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AbrQ5SSL4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
AbrQ5SSL4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AbrQ5SSL4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AbrQ5SSL4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AbrQ5SSL4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AbrQ5SSL4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AbrQ5SSL4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AbrQ5SSL4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AbrQ5SSL4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AbrQ5SSL4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AbrQ5SSL4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
AbrQ5SSL4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AbrQ5SSL4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AbrQ5SSL4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AbrQ5SSL4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AbrQ5SSL4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AbrQ5SSL4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AbrQ5SSL4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AbrQ5SSL4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AbrQ5SSL4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AbrQ5SSL4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
AbrQ5SSL4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
AbrQ5SSL4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AbrQ5SSL4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AbrQ5SSL4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AbrQ5SSL4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AbrQ5SSL4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AbrQ5SSL4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AbrQ5SSL4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AbrQ5SSL4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AbrQ5SSL4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AbrQ5SSL4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AbrQ5SSL4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AbrQ5SSL4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AbrQ5SSL4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AbrQ5SSL4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AbrQ5SSL4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
AbrQ5SSL4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AbrQ5SSL4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AbrQ5SSL4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AbrQ5SSL4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AbrQ5SSL4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AbrQ5SSL4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AbrQ5SSL4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AbrQ5SSL4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AbrQ5SSL4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AbrQ5SSL4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AbrQ5SSL4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AbrQ5SSL4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AbrQ5SSL4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AbrQ5SSL4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AbrQ5SSL4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AbrQ5SSL4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AbrQ5SSL4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AbrQ5SSL4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AbrQ5SSL4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AbrQ5SSL4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AbrQ5SSL4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AbrQ5SSL4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AbrQ5SSL4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AbrQ5SSL4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AbrQ5SSL4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
AbrQ5SSL4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AbrQ5SSL4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AbrQ5SSL4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AbrQ5SSL4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AbrQ5SSL4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AbrQ5SSL4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
AbrQ5SSL4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
AbrQ5SSL4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
AbrQ5SSL4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AbrQ5SSL4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AbrQ5SSL4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AbrQ5SSL4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AbrQ5SSL4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AbrQ5SSL4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AbrQ5SSL4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AbrQ5SSL4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AbrQ5SSL4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AbrQ5SSL4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AbrQ5SSL4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AbrQ5SSL4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
AbrQ5SSL4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
AbrQ5SSL4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AbrQ5SSL4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
AbrQ5SSL4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AbrQ5SSL4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
AbrQ5SSL4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AbrQ5SSL4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
AbrQ5SSL4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms