Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc88aQ5SNZ0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc88aQ5SNZ0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc88aQ5SNZ0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc88aQ5SNZ0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc88aQ5SNZ0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc88aQ5SNZ0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc88aQ5SNZ0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc88aQ5SNZ0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc88aQ5SNZ0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc88aQ5SNZ0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccdc88aQ5SNZ0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc88aQ5SNZ0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc88aQ5SNZ0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc88aQ5SNZ0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc88aQ5SNZ0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc88aQ5SNZ0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc88aQ5SNZ0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc88aQ5SNZ0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc88aQ5SNZ0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc88aQ5SNZ0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc88aQ5SNZ0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc88aQ5SNZ0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc88aQ5SNZ0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc88aQ5SNZ0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc88aQ5SNZ0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc88aQ5SNZ0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc88aQ5SNZ0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc88aQ5SNZ0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc88aQ5SNZ0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc88aQ5SNZ0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc88aQ5SNZ0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc88aQ5SNZ0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc88aQ5SNZ0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc88aQ5SNZ0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc88aQ5SNZ0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc88aQ5SNZ0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc88aQ5SNZ0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc88aQ5SNZ0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc88aQ5SNZ0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc88aQ5SNZ0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc88aQ5SNZ0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc88aQ5SNZ0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc88aQ5SNZ0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc88aQ5SNZ0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc88aQ5SNZ0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc88aQ5SNZ0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc88aQ5SNZ0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc88aQ5SNZ0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc88aQ5SNZ0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc88aQ5SNZ0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc88aQ5SNZ0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc88aQ5SNZ0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc88aQ5SNZ0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc88aQ5SNZ0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc88aQ5SNZ0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc88aQ5SNZ0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc88aQ5SNZ0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc88aQ5SNZ0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc88aQ5SNZ0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc88aQ5SNZ0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc88aQ5SNZ0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc88aQ5SNZ0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc88aQ5SNZ0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc88aQ5SNZ0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc88aQ5SNZ0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc88aQ5SNZ0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc88aQ5SNZ0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc88aQ5SNZ0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc88aQ5SNZ0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc88aQ5SNZ0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc88aQ5SNZ0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc88aQ5SNZ0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc88aQ5SNZ0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc88aQ5SNZ0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc88aQ5SNZ0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc88aQ5SNZ0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc88aQ5SNZ0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc88aQ5SNZ0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc88aQ5SNZ0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc88aQ5SNZ0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc88aQ5SNZ0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms