Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc1Q5NCF2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc1Q5NCF2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc1Q5NCF2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc1Q5NCF2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc1Q5NCF2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc1Q5NCF2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc1Q5NCF2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc1Q5NCF2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc1Q5NCF2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc1Q5NCF2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc1Q5NCF2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc1Q5NCF2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc1Q5NCF2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc1Q5NCF2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc1Q5NCF2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc1Q5NCF2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc1Q5NCF2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc1Q5NCF2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc1Q5NCF2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc1Q5NCF2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc1Q5NCF2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc1Q5NCF2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc1Q5NCF2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc1Q5NCF2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc1Q5NCF2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc1Q5NCF2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc1Q5NCF2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc1Q5NCF2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc1Q5NCF2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc1Q5NCF2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc1Q5NCF2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc1Q5NCF2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc1Q5NCF2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc1Q5NCF2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc1Q5NCF2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc1Q5NCF2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc1Q5NCF2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc1Q5NCF2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc1Q5NCF2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc1Q5NCF2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc1Q5NCF2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc1Q5NCF2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc1Q5NCF2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc1Q5NCF2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc1Q5NCF2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc1Q5NCF2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc1Q5NCF2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc1Q5NCF2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc1Q5NCF2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc1Q5NCF2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc1Q5NCF2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc1Q5NCF2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc1Q5NCF2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc1Q5NCF2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc1Q5NCF2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc1Q5NCF2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc1Q5NCF2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc1Q5NCF2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc1Q5NCF2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc1Q5NCF2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc1Q5NCF2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc1Q5NCF2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trappc1Q5NCF2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trappc1Q5NCF2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc1Q5NCF2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc1Q5NCF2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc1Q5NCF2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc1Q5NCF2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc1Q5NCF2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc1Q5NCF2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc1Q5NCF2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc1Q5NCF2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc1Q5NCF2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc1Q5NCF2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc1Q5NCF2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc1Q5NCF2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc1Q5NCF2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc1Q5NCF2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc1Q5NCF2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc1Q5NCF2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc1Q5NCF2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc1Q5NCF2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc1Q5NCF2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc1Q5NCF2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc1Q5NCF2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc1Q5NCF2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc1Q5NCF2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc1Q5NCF2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc1Q5NCF2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc1Q5NCF2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc1Q5NCF2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc1Q5NCF2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc1Q5NCF2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc1Q5NCF2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc1Q5NCF2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc1Q5NCF2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc1Q5NCF2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc1Q5NCF2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc1Q5NCF2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms