Protein–RNA interactions for Protein: Q5IBH7

Spdya, Speedy protein A, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpdyaQ5IBH7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SpdyaQ5IBH7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SpdyaQ5IBH7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SpdyaQ5IBH7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SpdyaQ5IBH7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SpdyaQ5IBH7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SpdyaQ5IBH7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SpdyaQ5IBH7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SpdyaQ5IBH7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SpdyaQ5IBH7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SpdyaQ5IBH7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SpdyaQ5IBH7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SpdyaQ5IBH7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SpdyaQ5IBH7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SpdyaQ5IBH7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SpdyaQ5IBH7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SpdyaQ5IBH7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SpdyaQ5IBH7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SpdyaQ5IBH7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SpdyaQ5IBH7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
SpdyaQ5IBH7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SpdyaQ5IBH7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SpdyaQ5IBH7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SpdyaQ5IBH7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SpdyaQ5IBH7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SpdyaQ5IBH7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SpdyaQ5IBH7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SpdyaQ5IBH7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SpdyaQ5IBH7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SpdyaQ5IBH7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SpdyaQ5IBH7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SpdyaQ5IBH7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SpdyaQ5IBH7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SpdyaQ5IBH7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SpdyaQ5IBH7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SpdyaQ5IBH7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SpdyaQ5IBH7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SpdyaQ5IBH7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SpdyaQ5IBH7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SpdyaQ5IBH7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SpdyaQ5IBH7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SpdyaQ5IBH7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SpdyaQ5IBH7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SpdyaQ5IBH7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SpdyaQ5IBH7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SpdyaQ5IBH7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SpdyaQ5IBH7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SpdyaQ5IBH7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SpdyaQ5IBH7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SpdyaQ5IBH7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SpdyaQ5IBH7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SpdyaQ5IBH7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SpdyaQ5IBH7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SpdyaQ5IBH7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SpdyaQ5IBH7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SpdyaQ5IBH7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SpdyaQ5IBH7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SpdyaQ5IBH7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SpdyaQ5IBH7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SpdyaQ5IBH7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SpdyaQ5IBH7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SpdyaQ5IBH7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SpdyaQ5IBH7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SpdyaQ5IBH7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SpdyaQ5IBH7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SpdyaQ5IBH7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SpdyaQ5IBH7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SpdyaQ5IBH7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SpdyaQ5IBH7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SpdyaQ5IBH7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SpdyaQ5IBH7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SpdyaQ5IBH7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SpdyaQ5IBH7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SpdyaQ5IBH7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SpdyaQ5IBH7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SpdyaQ5IBH7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SpdyaQ5IBH7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SpdyaQ5IBH7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SpdyaQ5IBH7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SpdyaQ5IBH7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SpdyaQ5IBH7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SpdyaQ5IBH7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SpdyaQ5IBH7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SpdyaQ5IBH7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SpdyaQ5IBH7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SpdyaQ5IBH7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SpdyaQ5IBH7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SpdyaQ5IBH7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SpdyaQ5IBH7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SpdyaQ5IBH7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SpdyaQ5IBH7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SpdyaQ5IBH7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SpdyaQ5IBH7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SpdyaQ5IBH7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SpdyaQ5IBH7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SpdyaQ5IBH7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SpdyaQ5IBH7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SpdyaQ5IBH7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SpdyaQ5IBH7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SpdyaQ5IBH7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms