Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prkaa1Q5EG47 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prkaa1Q5EG47 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prkaa1Q5EG47 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prkaa1Q5EG47 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prkaa1Q5EG47 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prkaa1Q5EG47 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Prkaa1Q5EG47 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prkaa1Q5EG47 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prkaa1Q5EG47 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prkaa1Q5EG47 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prkaa1Q5EG47 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prkaa1Q5EG47 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Prkaa1Q5EG47 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Prkaa1Q5EG47 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prkaa1Q5EG47 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prkaa1Q5EG47 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prkaa1Q5EG47 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prkaa1Q5EG47 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Prkaa1Q5EG47 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prkaa1Q5EG47 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prkaa1Q5EG47 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prkaa1Q5EG47 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prkaa1Q5EG47 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prkaa1Q5EG47 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prkaa1Q5EG47 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prkaa1Q5EG47 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prkaa1Q5EG47 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prkaa1Q5EG47 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prkaa1Q5EG47 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Prkaa1Q5EG47 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prkaa1Q5EG47 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prkaa1Q5EG47 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Prkaa1Q5EG47 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prkaa1Q5EG47 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prkaa1Q5EG47 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prkaa1Q5EG47 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prkaa1Q5EG47 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prkaa1Q5EG47 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Prkaa1Q5EG47 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prkaa1Q5EG47 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prkaa1Q5EG47 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prkaa1Q5EG47 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prkaa1Q5EG47 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prkaa1Q5EG47 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Prkaa1Q5EG47 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prkaa1Q5EG47 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prkaa1Q5EG47 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prkaa1Q5EG47 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prkaa1Q5EG47 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prkaa1Q5EG47 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prkaa1Q5EG47 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prkaa1Q5EG47 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prkaa1Q5EG47 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prkaa1Q5EG47 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Prkaa1Q5EG47 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prkaa1Q5EG47 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Prkaa1Q5EG47 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prkaa1Q5EG47 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Prkaa1Q5EG47 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prkaa1Q5EG47 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prkaa1Q5EG47 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Prkaa1Q5EG47 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prkaa1Q5EG47 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prkaa1Q5EG47 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prkaa1Q5EG47 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prkaa1Q5EG47 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prkaa1Q5EG47 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prkaa1Q5EG47 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prkaa1Q5EG47 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prkaa1Q5EG47 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prkaa1Q5EG47 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prkaa1Q5EG47 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prkaa1Q5EG47 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prkaa1Q5EG47 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Prkaa1Q5EG47 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prkaa1Q5EG47 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Prkaa1Q5EG47 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Prkaa1Q5EG47 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Prkaa1Q5EG47 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prkaa1Q5EG47 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prkaa1Q5EG47 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prkaa1Q5EG47 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prkaa1Q5EG47 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prkaa1Q5EG47 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prkaa1Q5EG47 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Prkaa1Q5EG47 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prkaa1Q5EG47 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prkaa1Q5EG47 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prkaa1Q5EG47 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prkaa1Q5EG47 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prkaa1Q5EG47 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prkaa1Q5EG47 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prkaa1Q5EG47 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prkaa1Q5EG47 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prkaa1Q5EG47 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prkaa1Q5EG47 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prkaa1Q5EG47 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prkaa1Q5EG47 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prkaa1Q5EG47 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.8 ms