Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ndufaf2Q59J78 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ndufaf2Q59J78 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ndufaf2Q59J78 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ndufaf2Q59J78 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ndufaf2Q59J78 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ndufaf2Q59J78 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ndufaf2Q59J78 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ndufaf2Q59J78 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ndufaf2Q59J78 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ndufaf2Q59J78 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ndufaf2Q59J78 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ndufaf2Q59J78 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ndufaf2Q59J78 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ndufaf2Q59J78 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ndufaf2Q59J78 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ndufaf2Q59J78 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ndufaf2Q59J78 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ndufaf2Q59J78 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ndufaf2Q59J78 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ndufaf2Q59J78 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ndufaf2Q59J78 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ndufaf2Q59J78 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ndufaf2Q59J78 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ndufaf2Q59J78 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ndufaf2Q59J78 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ndufaf2Q59J78 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ndufaf2Q59J78 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ndufaf2Q59J78 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ndufaf2Q59J78 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ndufaf2Q59J78 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ndufaf2Q59J78 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ndufaf2Q59J78 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ndufaf2Q59J78 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ndufaf2Q59J78 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ndufaf2Q59J78 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ndufaf2Q59J78 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ndufaf2Q59J78 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ndufaf2Q59J78 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ndufaf2Q59J78 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ndufaf2Q59J78 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ndufaf2Q59J78 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ndufaf2Q59J78 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ndufaf2Q59J78 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ndufaf2Q59J78 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ndufaf2Q59J78 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ndufaf2Q59J78 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ndufaf2Q59J78 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ndufaf2Q59J78 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ndufaf2Q59J78 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ndufaf2Q59J78 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ndufaf2Q59J78 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ndufaf2Q59J78 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ndufaf2Q59J78 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ndufaf2Q59J78 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ndufaf2Q59J78 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ndufaf2Q59J78 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ndufaf2Q59J78 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ndufaf2Q59J78 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ndufaf2Q59J78 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ndufaf2Q59J78 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ndufaf2Q59J78 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ndufaf2Q59J78 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndufaf2Q59J78 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndufaf2Q59J78 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndufaf2Q59J78 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndufaf2Q59J78 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndufaf2Q59J78 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndufaf2Q59J78 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ndufaf2Q59J78 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ndufaf2Q59J78 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ndufaf2Q59J78 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ndufaf2Q59J78 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ndufaf2Q59J78 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ndufaf2Q59J78 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ndufaf2Q59J78 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ndufaf2Q59J78 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ndufaf2Q59J78 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ndufaf2Q59J78 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ndufaf2Q59J78 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ndufaf2Q59J78 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ndufaf2Q59J78 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ndufaf2Q59J78 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ndufaf2Q59J78 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ndufaf2Q59J78 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ndufaf2Q59J78 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ndufaf2Q59J78 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ndufaf2Q59J78 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ndufaf2Q59J78 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ndufaf2Q59J78 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ndufaf2Q59J78 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ndufaf2Q59J78 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ndufaf2Q59J78 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ndufaf2Q59J78 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ndufaf2Q59J78 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ndufaf2Q59J78 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ndufaf2Q59J78 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ndufaf2Q59J78 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ndufaf2Q59J78 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ndufaf2Q59J78 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 145.6 ms