Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1B8

Gal3st4, Galactose-3-O-sulfotransferase 4, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gal3st4Q3V1B8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gal3st4Q3V1B8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gal3st4Q3V1B8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gal3st4Q3V1B8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gal3st4Q3V1B8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gal3st4Q3V1B8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gal3st4Q3V1B8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gal3st4Q3V1B8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gal3st4Q3V1B8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gal3st4Q3V1B8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gal3st4Q3V1B8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gal3st4Q3V1B8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gal3st4Q3V1B8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gal3st4Q3V1B8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gal3st4Q3V1B8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gal3st4Q3V1B8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gal3st4Q3V1B8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gal3st4Q3V1B8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gal3st4Q3V1B8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gal3st4Q3V1B8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gal3st4Q3V1B8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gal3st4Q3V1B8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gal3st4Q3V1B8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gal3st4Q3V1B8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gal3st4Q3V1B8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gal3st4Q3V1B8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gal3st4Q3V1B8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gal3st4Q3V1B8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gal3st4Q3V1B8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gal3st4Q3V1B8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gal3st4Q3V1B8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gal3st4Q3V1B8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gal3st4Q3V1B8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gal3st4Q3V1B8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gal3st4Q3V1B8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gal3st4Q3V1B8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gal3st4Q3V1B8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gal3st4Q3V1B8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gal3st4Q3V1B8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gal3st4Q3V1B8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gal3st4Q3V1B8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gal3st4Q3V1B8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gal3st4Q3V1B8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gal3st4Q3V1B8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gal3st4Q3V1B8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gal3st4Q3V1B8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gal3st4Q3V1B8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gal3st4Q3V1B8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gal3st4Q3V1B8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gal3st4Q3V1B8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gal3st4Q3V1B8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gal3st4Q3V1B8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gal3st4Q3V1B8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gal3st4Q3V1B8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gal3st4Q3V1B8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gal3st4Q3V1B8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gal3st4Q3V1B8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gal3st4Q3V1B8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gal3st4Q3V1B8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gal3st4Q3V1B8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gal3st4Q3V1B8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gal3st4Q3V1B8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gal3st4Q3V1B8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gal3st4Q3V1B8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gal3st4Q3V1B8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gal3st4Q3V1B8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gal3st4Q3V1B8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gal3st4Q3V1B8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gal3st4Q3V1B8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gal3st4Q3V1B8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gal3st4Q3V1B8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gal3st4Q3V1B8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gal3st4Q3V1B8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gal3st4Q3V1B8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gal3st4Q3V1B8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gal3st4Q3V1B8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gal3st4Q3V1B8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gal3st4Q3V1B8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gal3st4Q3V1B8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gal3st4Q3V1B8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gal3st4Q3V1B8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gal3st4Q3V1B8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gal3st4Q3V1B8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gal3st4Q3V1B8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gal3st4Q3V1B8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gal3st4Q3V1B8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gal3st4Q3V1B8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gal3st4Q3V1B8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gal3st4Q3V1B8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gal3st4Q3V1B8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gal3st4Q3V1B8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gal3st4Q3V1B8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gal3st4Q3V1B8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gal3st4Q3V1B8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gal3st4Q3V1B8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gal3st4Q3V1B8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gal3st4Q3V1B8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gal3st4Q3V1B8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gal3st4Q3V1B8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gal3st4Q3V1B8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms