Protein–RNA interactions for Protein: Q3V079

Bbof1, Basal body-orientation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbof1Q3V079 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Bbof1Q3V079 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Bbof1Q3V079 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Bbof1Q3V079 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Bbof1Q3V079 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Bbof1Q3V079 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Bbof1Q3V079 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Bbof1Q3V079 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Bbof1Q3V079 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Bbof1Q3V079 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Bbof1Q3V079 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Bbof1Q3V079 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Bbof1Q3V079 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Bbof1Q3V079 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Bbof1Q3V079 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Bbof1Q3V079 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Bbof1Q3V079 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Bbof1Q3V079 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Bbof1Q3V079 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Bbof1Q3V079 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Bbof1Q3V079 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Bbof1Q3V079 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Bbof1Q3V079 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Bbof1Q3V079 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Bbof1Q3V079 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Bbof1Q3V079 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Bbof1Q3V079 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Bbof1Q3V079 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Bbof1Q3V079 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Bbof1Q3V079 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Bbof1Q3V079 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Bbof1Q3V079 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Bbof1Q3V079 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Bbof1Q3V079 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Bbof1Q3V079 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Bbof1Q3V079 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Bbof1Q3V079 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Bbof1Q3V079 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Bbof1Q3V079 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Bbof1Q3V079 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bbof1Q3V079 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bbof1Q3V079 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bbof1Q3V079 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bbof1Q3V079 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bbof1Q3V079 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bbof1Q3V079 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bbof1Q3V079 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bbof1Q3V079 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bbof1Q3V079 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bbof1Q3V079 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bbof1Q3V079 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bbof1Q3V079 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bbof1Q3V079 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bbof1Q3V079 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bbof1Q3V079 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bbof1Q3V079 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bbof1Q3V079 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bbof1Q3V079 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bbof1Q3V079 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bbof1Q3V079 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Bbof1Q3V079 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bbof1Q3V079 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bbof1Q3V079 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bbof1Q3V079 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bbof1Q3V079 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bbof1Q3V079 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bbof1Q3V079 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bbof1Q3V079 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bbof1Q3V079 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bbof1Q3V079 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bbof1Q3V079 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bbof1Q3V079 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Bbof1Q3V079 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bbof1Q3V079 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bbof1Q3V079 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bbof1Q3V079 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bbof1Q3V079 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bbof1Q3V079 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bbof1Q3V079 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bbof1Q3V079 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bbof1Q3V079 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bbof1Q3V079 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bbof1Q3V079 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bbof1Q3V079 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Bbof1Q3V079 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Bbof1Q3V079 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Bbof1Q3V079 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bbof1Q3V079 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bbof1Q3V079 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bbof1Q3V079 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bbof1Q3V079 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bbof1Q3V079 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bbof1Q3V079 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bbof1Q3V079 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bbof1Q3V079 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Bbof1Q3V079 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bbof1Q3V079 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bbof1Q3V079 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bbof1Q3V079 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bbof1Q3V079 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms