Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc27Q3V036 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc27Q3V036 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc27Q3V036 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc27Q3V036 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc27Q3V036 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc27Q3V036 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc27Q3V036 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc27Q3V036 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc27Q3V036 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc27Q3V036 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc27Q3V036 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc27Q3V036 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc27Q3V036 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc27Q3V036 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc27Q3V036 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc27Q3V036 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc27Q3V036 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc27Q3V036 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc27Q3V036 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc27Q3V036 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc27Q3V036 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc27Q3V036 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc27Q3V036 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc27Q3V036 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc27Q3V036 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc27Q3V036 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc27Q3V036 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc27Q3V036 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc27Q3V036 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc27Q3V036 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc27Q3V036 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc27Q3V036 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc27Q3V036 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc27Q3V036 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc27Q3V036 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc27Q3V036 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc27Q3V036 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc27Q3V036 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc27Q3V036 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc27Q3V036 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc27Q3V036 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc27Q3V036 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc27Q3V036 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc27Q3V036 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc27Q3V036 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc27Q3V036 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc27Q3V036 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc27Q3V036 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc27Q3V036 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc27Q3V036 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc27Q3V036 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc27Q3V036 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc27Q3V036 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc27Q3V036 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc27Q3V036 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc27Q3V036 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc27Q3V036 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc27Q3V036 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc27Q3V036 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc27Q3V036 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc27Q3V036 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc27Q3V036 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc27Q3V036 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc27Q3V036 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc27Q3V036 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc27Q3V036 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ccdc27Q3V036 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc27Q3V036 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc27Q3V036 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc27Q3V036 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc27Q3V036 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc27Q3V036 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc27Q3V036 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc27Q3V036 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc27Q3V036 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc27Q3V036 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc27Q3V036 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc27Q3V036 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc27Q3V036 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc27Q3V036 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc27Q3V036 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc27Q3V036 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc27Q3V036 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc27Q3V036 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc27Q3V036 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc27Q3V036 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc27Q3V036 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc27Q3V036 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc27Q3V036 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc27Q3V036 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc27Q3V036 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc27Q3V036 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc27Q3V036 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc27Q3V036 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc27Q3V036 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc27Q3V036 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc27Q3V036 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc27Q3V036 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc27Q3V036 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms