Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Capn13Q3UW68 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Capn13Q3UW68 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Capn13Q3UW68 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Capn13Q3UW68 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Capn13Q3UW68 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Capn13Q3UW68 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Capn13Q3UW68 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Capn13Q3UW68 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Capn13Q3UW68 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Capn13Q3UW68 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Capn13Q3UW68 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Capn13Q3UW68 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Capn13Q3UW68 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Capn13Q3UW68 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Capn13Q3UW68 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Capn13Q3UW68 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Capn13Q3UW68 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Capn13Q3UW68 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Capn13Q3UW68 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Capn13Q3UW68 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Capn13Q3UW68 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Capn13Q3UW68 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Capn13Q3UW68 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Capn13Q3UW68 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Capn13Q3UW68 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Capn13Q3UW68 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Capn13Q3UW68 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Capn13Q3UW68 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Capn13Q3UW68 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Capn13Q3UW68 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Capn13Q3UW68 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Capn13Q3UW68 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Capn13Q3UW68 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Capn13Q3UW68 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Capn13Q3UW68 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Capn13Q3UW68 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Capn13Q3UW68 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Capn13Q3UW68 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Capn13Q3UW68 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Capn13Q3UW68 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Capn13Q3UW68 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Capn13Q3UW68 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Capn13Q3UW68 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Capn13Q3UW68 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Capn13Q3UW68 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Capn13Q3UW68 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Capn13Q3UW68 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Capn13Q3UW68 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Capn13Q3UW68 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Capn13Q3UW68 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Capn13Q3UW68 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Capn13Q3UW68 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Capn13Q3UW68 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Capn13Q3UW68 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Capn13Q3UW68 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Capn13Q3UW68 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Capn13Q3UW68 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Capn13Q3UW68 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Capn13Q3UW68 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Capn13Q3UW68 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Capn13Q3UW68 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Capn13Q3UW68 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Capn13Q3UW68 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Capn13Q3UW68 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Capn13Q3UW68 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Capn13Q3UW68 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Capn13Q3UW68 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Capn13Q3UW68 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Capn13Q3UW68 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Capn13Q3UW68 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Capn13Q3UW68 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Capn13Q3UW68 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Capn13Q3UW68 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Capn13Q3UW68 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Capn13Q3UW68 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Capn13Q3UW68 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Capn13Q3UW68 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Capn13Q3UW68 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Capn13Q3UW68 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Capn13Q3UW68 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Capn13Q3UW68 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Capn13Q3UW68 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Capn13Q3UW68 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Capn13Q3UW68 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Capn13Q3UW68 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Capn13Q3UW68 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Capn13Q3UW68 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Capn13Q3UW68 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Capn13Q3UW68 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Capn13Q3UW68 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Capn13Q3UW68 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Capn13Q3UW68 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Capn13Q3UW68 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Capn13Q3UW68 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Capn13Q3UW68 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Capn13Q3UW68 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Capn13Q3UW68 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Capn13Q3UW68 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Capn13Q3UW68 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms