Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
D130052B06RikQ3UW13 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
D130052B06RikQ3UW13 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
D130052B06RikQ3UW13 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
D130052B06RikQ3UW13 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
D130052B06RikQ3UW13 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
D130052B06RikQ3UW13 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
D130052B06RikQ3UW13 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
D130052B06RikQ3UW13 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
D130052B06RikQ3UW13 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
D130052B06RikQ3UW13 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
D130052B06RikQ3UW13 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
D130052B06RikQ3UW13 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
D130052B06RikQ3UW13 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
D130052B06RikQ3UW13 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
D130052B06RikQ3UW13 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
D130052B06RikQ3UW13 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
D130052B06RikQ3UW13 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
D130052B06RikQ3UW13 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
D130052B06RikQ3UW13 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
D130052B06RikQ3UW13 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
D130052B06RikQ3UW13 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
D130052B06RikQ3UW13 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
D130052B06RikQ3UW13 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
D130052B06RikQ3UW13 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
D130052B06RikQ3UW13 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
D130052B06RikQ3UW13 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
D130052B06RikQ3UW13 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
D130052B06RikQ3UW13 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
D130052B06RikQ3UW13 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
D130052B06RikQ3UW13 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
D130052B06RikQ3UW13 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
D130052B06RikQ3UW13 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
D130052B06RikQ3UW13 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
D130052B06RikQ3UW13 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
D130052B06RikQ3UW13 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
D130052B06RikQ3UW13 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
D130052B06RikQ3UW13 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
D130052B06RikQ3UW13 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
D130052B06RikQ3UW13 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
D130052B06RikQ3UW13 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
D130052B06RikQ3UW13 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
D130052B06RikQ3UW13 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
D130052B06RikQ3UW13 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
D130052B06RikQ3UW13 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
D130052B06RikQ3UW13 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
D130052B06RikQ3UW13 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
D130052B06RikQ3UW13 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
D130052B06RikQ3UW13 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
D130052B06RikQ3UW13 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
D130052B06RikQ3UW13 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
D130052B06RikQ3UW13 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
D130052B06RikQ3UW13 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
D130052B06RikQ3UW13 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
D130052B06RikQ3UW13 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
D130052B06RikQ3UW13 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
D130052B06RikQ3UW13 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
D130052B06RikQ3UW13 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
D130052B06RikQ3UW13 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
D130052B06RikQ3UW13 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
D130052B06RikQ3UW13 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
D130052B06RikQ3UW13 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
D130052B06RikQ3UW13 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
D130052B06RikQ3UW13 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
D130052B06RikQ3UW13 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
D130052B06RikQ3UW13 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
D130052B06RikQ3UW13 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
D130052B06RikQ3UW13 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
D130052B06RikQ3UW13 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
D130052B06RikQ3UW13 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
D130052B06RikQ3UW13 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
D130052B06RikQ3UW13 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
D130052B06RikQ3UW13 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
D130052B06RikQ3UW13 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
D130052B06RikQ3UW13 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
D130052B06RikQ3UW13 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
D130052B06RikQ3UW13 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
D130052B06RikQ3UW13 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
D130052B06RikQ3UW13 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
D130052B06RikQ3UW13 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
D130052B06RikQ3UW13 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
D130052B06RikQ3UW13 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
D130052B06RikQ3UW13 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
D130052B06RikQ3UW13 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
D130052B06RikQ3UW13 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
D130052B06RikQ3UW13 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
D130052B06RikQ3UW13 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
D130052B06RikQ3UW13 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
D130052B06RikQ3UW13 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
D130052B06RikQ3UW13 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
D130052B06RikQ3UW13 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
D130052B06RikQ3UW13 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
D130052B06RikQ3UW13 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
D130052B06RikQ3UW13 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
D130052B06RikQ3UW13 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
D130052B06RikQ3UW13 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
D130052B06RikQ3UW13 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
D130052B06RikQ3UW13 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
D130052B06RikQ3UW13 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
D130052B06RikQ3UW13 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms