Protein–RNA interactions for Protein: Q3URS2

Zscan4f, Zinc finger and SCAN domain containing protein 4F, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan4fQ3URS2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zscan4fQ3URS2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zscan4fQ3URS2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zscan4fQ3URS2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zscan4fQ3URS2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Zscan4fQ3URS2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zscan4fQ3URS2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zscan4fQ3URS2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zscan4fQ3URS2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zscan4fQ3URS2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zscan4fQ3URS2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zscan4fQ3URS2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zscan4fQ3URS2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zscan4fQ3URS2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zscan4fQ3URS2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zscan4fQ3URS2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zscan4fQ3URS2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zscan4fQ3URS2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zscan4fQ3URS2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zscan4fQ3URS2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zscan4fQ3URS2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zscan4fQ3URS2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Zscan4fQ3URS2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zscan4fQ3URS2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zscan4fQ3URS2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zscan4fQ3URS2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zscan4fQ3URS2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zscan4fQ3URS2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zscan4fQ3URS2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zscan4fQ3URS2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zscan4fQ3URS2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zscan4fQ3URS2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zscan4fQ3URS2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zscan4fQ3URS2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zscan4fQ3URS2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zscan4fQ3URS2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zscan4fQ3URS2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zscan4fQ3URS2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zscan4fQ3URS2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zscan4fQ3URS2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zscan4fQ3URS2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zscan4fQ3URS2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zscan4fQ3URS2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zscan4fQ3URS2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zscan4fQ3URS2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Zscan4fQ3URS2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zscan4fQ3URS2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zscan4fQ3URS2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zscan4fQ3URS2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Zscan4fQ3URS2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zscan4fQ3URS2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zscan4fQ3URS2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zscan4fQ3URS2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zscan4fQ3URS2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zscan4fQ3URS2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zscan4fQ3URS2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zscan4fQ3URS2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zscan4fQ3URS2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zscan4fQ3URS2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zscan4fQ3URS2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zscan4fQ3URS2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zscan4fQ3URS2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zscan4fQ3URS2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zscan4fQ3URS2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zscan4fQ3URS2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zscan4fQ3URS2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zscan4fQ3URS2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zscan4fQ3URS2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zscan4fQ3URS2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zscan4fQ3URS2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zscan4fQ3URS2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zscan4fQ3URS2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zscan4fQ3URS2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zscan4fQ3URS2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zscan4fQ3URS2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zscan4fQ3URS2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zscan4fQ3URS2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Zscan4fQ3URS2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zscan4fQ3URS2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zscan4fQ3URS2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zscan4fQ3URS2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zscan4fQ3URS2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Zscan4fQ3URS2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Zscan4fQ3URS2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zscan4fQ3URS2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zscan4fQ3URS2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zscan4fQ3URS2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zscan4fQ3URS2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zscan4fQ3URS2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zscan4fQ3URS2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zscan4fQ3URS2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zscan4fQ3URS2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zscan4fQ3URS2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zscan4fQ3URS2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zscan4fQ3URS2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zscan4fQ3URS2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zscan4fQ3URS2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zscan4fQ3URS2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zscan4fQ3URS2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zscan4fQ3URS2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms