Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQ41

Tmprss11a, Transmembrane protease serine 11A, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmprss11aQ3UQ41 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmprss11aQ3UQ41 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmprss11aQ3UQ41 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmprss11aQ3UQ41 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmprss11aQ3UQ41 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmprss11aQ3UQ41 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmprss11aQ3UQ41 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmprss11aQ3UQ41 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmprss11aQ3UQ41 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmprss11aQ3UQ41 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmprss11aQ3UQ41 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmprss11aQ3UQ41 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Tmprss11aQ3UQ41 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmprss11aQ3UQ41 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmprss11aQ3UQ41 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmprss11aQ3UQ41 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmprss11aQ3UQ41 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmprss11aQ3UQ41 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmprss11aQ3UQ41 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmprss11aQ3UQ41 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmprss11aQ3UQ41 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmprss11aQ3UQ41 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmprss11aQ3UQ41 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmprss11aQ3UQ41 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmprss11aQ3UQ41 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmprss11aQ3UQ41 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmprss11aQ3UQ41 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmprss11aQ3UQ41 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmprss11aQ3UQ41 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmprss11aQ3UQ41 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmprss11aQ3UQ41 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmprss11aQ3UQ41 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmprss11aQ3UQ41 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmprss11aQ3UQ41 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmprss11aQ3UQ41 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmprss11aQ3UQ41 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmprss11aQ3UQ41 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmprss11aQ3UQ41 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmprss11aQ3UQ41 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmprss11aQ3UQ41 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmprss11aQ3UQ41 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmprss11aQ3UQ41 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmprss11aQ3UQ41 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmprss11aQ3UQ41 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmprss11aQ3UQ41 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmprss11aQ3UQ41 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmprss11aQ3UQ41 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmprss11aQ3UQ41 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmprss11aQ3UQ41 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmprss11aQ3UQ41 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmprss11aQ3UQ41 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmprss11aQ3UQ41 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmprss11aQ3UQ41 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmprss11aQ3UQ41 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmprss11aQ3UQ41 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmprss11aQ3UQ41 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmprss11aQ3UQ41 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmprss11aQ3UQ41 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmprss11aQ3UQ41 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmprss11aQ3UQ41 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmprss11aQ3UQ41 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmprss11aQ3UQ41 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmprss11aQ3UQ41 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmprss11aQ3UQ41 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmprss11aQ3UQ41 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmprss11aQ3UQ41 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmprss11aQ3UQ41 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmprss11aQ3UQ41 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmprss11aQ3UQ41 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmprss11aQ3UQ41 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmprss11aQ3UQ41 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmprss11aQ3UQ41 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmprss11aQ3UQ41 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmprss11aQ3UQ41 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmprss11aQ3UQ41 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmprss11aQ3UQ41 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmprss11aQ3UQ41 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmprss11aQ3UQ41 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmprss11aQ3UQ41 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmprss11aQ3UQ41 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmprss11aQ3UQ41 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmprss11aQ3UQ41 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmprss11aQ3UQ41 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmprss11aQ3UQ41 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmprss11aQ3UQ41 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmprss11aQ3UQ41 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmprss11aQ3UQ41 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmprss11aQ3UQ41 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmprss11aQ3UQ41 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmprss11aQ3UQ41 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmprss11aQ3UQ41 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmprss11aQ3UQ41 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmprss11aQ3UQ41 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmprss11aQ3UQ41 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmprss11aQ3UQ41 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmprss11aQ3UQ41 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmprss11aQ3UQ41 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmprss11aQ3UQ41 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmprss11aQ3UQ41 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmprss11aQ3UQ41 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms