Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULD5

Mccc2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc2Q3ULD5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mccc2Q3ULD5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mccc2Q3ULD5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mccc2Q3ULD5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mccc2Q3ULD5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Mccc2Q3ULD5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Mccc2Q3ULD5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mccc2Q3ULD5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mccc2Q3ULD5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mccc2Q3ULD5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Mccc2Q3ULD5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mccc2Q3ULD5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mccc2Q3ULD5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mccc2Q3ULD5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mccc2Q3ULD5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mccc2Q3ULD5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mccc2Q3ULD5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Mccc2Q3ULD5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Mccc2Q3ULD5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mccc2Q3ULD5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mccc2Q3ULD5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mccc2Q3ULD5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mccc2Q3ULD5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mccc2Q3ULD5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mccc2Q3ULD5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mccc2Q3ULD5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mccc2Q3ULD5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mccc2Q3ULD5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mccc2Q3ULD5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mccc2Q3ULD5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mccc2Q3ULD5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mccc2Q3ULD5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mccc2Q3ULD5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Mccc2Q3ULD5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Mccc2Q3ULD5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mccc2Q3ULD5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mccc2Q3ULD5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mccc2Q3ULD5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mccc2Q3ULD5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mccc2Q3ULD5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mccc2Q3ULD5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mccc2Q3ULD5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mccc2Q3ULD5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mccc2Q3ULD5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mccc2Q3ULD5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mccc2Q3ULD5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mccc2Q3ULD5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mccc2Q3ULD5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mccc2Q3ULD5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mccc2Q3ULD5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mccc2Q3ULD5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mccc2Q3ULD5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mccc2Q3ULD5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mccc2Q3ULD5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Mccc2Q3ULD5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mccc2Q3ULD5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mccc2Q3ULD5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mccc2Q3ULD5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mccc2Q3ULD5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mccc2Q3ULD5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mccc2Q3ULD5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mccc2Q3ULD5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mccc2Q3ULD5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mccc2Q3ULD5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mccc2Q3ULD5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mccc2Q3ULD5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mccc2Q3ULD5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mccc2Q3ULD5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mccc2Q3ULD5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mccc2Q3ULD5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mccc2Q3ULD5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mccc2Q3ULD5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Mccc2Q3ULD5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mccc2Q3ULD5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mccc2Q3ULD5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mccc2Q3ULD5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mccc2Q3ULD5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mccc2Q3ULD5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mccc2Q3ULD5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mccc2Q3ULD5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mccc2Q3ULD5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mccc2Q3ULD5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mccc2Q3ULD5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mccc2Q3ULD5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mccc2Q3ULD5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mccc2Q3ULD5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mccc2Q3ULD5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mccc2Q3ULD5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mccc2Q3ULD5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mccc2Q3ULD5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mccc2Q3ULD5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mccc2Q3ULD5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mccc2Q3ULD5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mccc2Q3ULD5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mccc2Q3ULD5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mccc2Q3ULD5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mccc2Q3ULD5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mccc2Q3ULD5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mccc2Q3ULD5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mccc2Q3ULD5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms