Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHC0

Tnrc6c, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6cQ3UHC0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Tnrc6cQ3UHC0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Tnrc6cQ3UHC0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Tnrc6cQ3UHC0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Tnrc6cQ3UHC0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Tnrc6cQ3UHC0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Tnrc6cQ3UHC0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Tnrc6cQ3UHC0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Tnrc6cQ3UHC0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Tnrc6cQ3UHC0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Tnrc6cQ3UHC0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Tnrc6cQ3UHC0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Tnrc6cQ3UHC0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tnrc6cQ3UHC0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tnrc6cQ3UHC0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tnrc6cQ3UHC0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tnrc6cQ3UHC0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Tnrc6cQ3UHC0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tnrc6cQ3UHC0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Tnrc6cQ3UHC0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Tnrc6cQ3UHC0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Tnrc6cQ3UHC0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Tnrc6cQ3UHC0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tnrc6cQ3UHC0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tnrc6cQ3UHC0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Tnrc6cQ3UHC0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tnrc6cQ3UHC0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tnrc6cQ3UHC0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tnrc6cQ3UHC0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Tnrc6cQ3UHC0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Tnrc6cQ3UHC0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tnrc6cQ3UHC0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tnrc6cQ3UHC0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tnrc6cQ3UHC0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tnrc6cQ3UHC0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tnrc6cQ3UHC0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Tnrc6cQ3UHC0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Tnrc6cQ3UHC0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Tnrc6cQ3UHC0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Tnrc6cQ3UHC0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Tnrc6cQ3UHC0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Tnrc6cQ3UHC0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Tnrc6cQ3UHC0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tnrc6cQ3UHC0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Tnrc6cQ3UHC0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tnrc6cQ3UHC0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tnrc6cQ3UHC0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tnrc6cQ3UHC0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tnrc6cQ3UHC0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Tnrc6cQ3UHC0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Tnrc6cQ3UHC0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Tnrc6cQ3UHC0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Tnrc6cQ3UHC0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Tnrc6cQ3UHC0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Tnrc6cQ3UHC0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Tnrc6cQ3UHC0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Tnrc6cQ3UHC0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Tnrc6cQ3UHC0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Tnrc6cQ3UHC0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Tnrc6cQ3UHC0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Tnrc6cQ3UHC0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tnrc6cQ3UHC0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tnrc6cQ3UHC0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tnrc6cQ3UHC0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tnrc6cQ3UHC0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tnrc6cQ3UHC0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tnrc6cQ3UHC0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tnrc6cQ3UHC0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tnrc6cQ3UHC0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tnrc6cQ3UHC0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tnrc6cQ3UHC0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tnrc6cQ3UHC0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Tnrc6cQ3UHC0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tnrc6cQ3UHC0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tnrc6cQ3UHC0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tnrc6cQ3UHC0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tnrc6cQ3UHC0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Tnrc6cQ3UHC0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tnrc6cQ3UHC0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Tnrc6cQ3UHC0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Tnrc6cQ3UHC0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Tnrc6cQ3UHC0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Tnrc6cQ3UHC0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Tnrc6cQ3UHC0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Tnrc6cQ3UHC0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Tnrc6cQ3UHC0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Tnrc6cQ3UHC0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tnrc6cQ3UHC0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tnrc6cQ3UHC0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Tnrc6cQ3UHC0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Tnrc6cQ3UHC0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Tnrc6cQ3UHC0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Tnrc6cQ3UHC0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Tnrc6cQ3UHC0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Tnrc6cQ3UHC0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tnrc6cQ3UHC0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Tnrc6cQ3UHC0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tnrc6cQ3UHC0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tnrc6cQ3UHC0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tnrc6cQ3UHC0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms